Protein–RNA interactions for Protein: Q99PQ1

Trim12a, Tripartite motif-containing protein 12A, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim12aQ99PQ1 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Trim12aQ99PQ1 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Trim12aQ99PQ1 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Trim12aQ99PQ1 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
Trim12aQ99PQ1 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Trim12aQ99PQ1 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Trim12aQ99PQ1 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Trim12aQ99PQ1 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Trim12aQ99PQ1 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Trim12aQ99PQ1 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Trim12aQ99PQ1 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Trim12aQ99PQ1 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Trim12aQ99PQ1 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Trim12aQ99PQ1 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Trim12aQ99PQ1 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Trim12aQ99PQ1 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Trim12aQ99PQ1 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Trim12aQ99PQ1 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Trim12aQ99PQ1 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Trim12aQ99PQ1 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Trim12aQ99PQ1 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Trim12aQ99PQ1 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trim12aQ99PQ1 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Trim12aQ99PQ1 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trim12aQ99PQ1 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trim12aQ99PQ1 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trim12aQ99PQ1 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trim12aQ99PQ1 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trim12aQ99PQ1 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Trim12aQ99PQ1 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trim12aQ99PQ1 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Trim12aQ99PQ1 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Trim12aQ99PQ1 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Trim12aQ99PQ1 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Trim12aQ99PQ1 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trim12aQ99PQ1 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trim12aQ99PQ1 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trim12aQ99PQ1 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trim12aQ99PQ1 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trim12aQ99PQ1 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trim12aQ99PQ1 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trim12aQ99PQ1 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trim12aQ99PQ1 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trim12aQ99PQ1 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trim12aQ99PQ1 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trim12aQ99PQ1 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trim12aQ99PQ1 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trim12aQ99PQ1 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trim12aQ99PQ1 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trim12aQ99PQ1 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trim12aQ99PQ1 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trim12aQ99PQ1 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trim12aQ99PQ1 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trim12aQ99PQ1 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trim12aQ99PQ1 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trim12aQ99PQ1 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trim12aQ99PQ1 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trim12aQ99PQ1 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trim12aQ99PQ1 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trim12aQ99PQ1 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trim12aQ99PQ1 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trim12aQ99PQ1 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trim12aQ99PQ1 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trim12aQ99PQ1 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trim12aQ99PQ1 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trim12aQ99PQ1 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trim12aQ99PQ1 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Trim12aQ99PQ1 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trim12aQ99PQ1 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trim12aQ99PQ1 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trim12aQ99PQ1 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trim12aQ99PQ1 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trim12aQ99PQ1 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trim12aQ99PQ1 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trim12aQ99PQ1 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trim12aQ99PQ1 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trim12aQ99PQ1 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trim12aQ99PQ1 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trim12aQ99PQ1 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trim12aQ99PQ1 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trim12aQ99PQ1 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trim12aQ99PQ1 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trim12aQ99PQ1 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trim12aQ99PQ1 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trim12aQ99PQ1 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trim12aQ99PQ1 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trim12aQ99PQ1 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trim12aQ99PQ1 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trim12aQ99PQ1 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trim12aQ99PQ1 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Trim12aQ99PQ1 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trim12aQ99PQ1 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trim12aQ99PQ1 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trim12aQ99PQ1 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trim12aQ99PQ1 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trim12aQ99PQ1 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trim12aQ99PQ1 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trim12aQ99PQ1 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trim12aQ99PQ1 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Trim12aQ99PQ1 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
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