Protein–RNA interactions for Protein: Q99PM3

Gtf2a1, Transcription initiation factor IIA subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2a1Q99PM3 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Gtf2a1Q99PM3 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Gtf2a1Q99PM3 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Gtf2a1Q99PM3 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Gtf2a1Q99PM3 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Gtf2a1Q99PM3 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Gtf2a1Q99PM3 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Gtf2a1Q99PM3 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Gtf2a1Q99PM3 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Gtf2a1Q99PM3 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Gtf2a1Q99PM3 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Gtf2a1Q99PM3 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Gtf2a1Q99PM3 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Gtf2a1Q99PM3 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Gtf2a1Q99PM3 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Gtf2a1Q99PM3 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Gtf2a1Q99PM3 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Gtf2a1Q99PM3 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Gtf2a1Q99PM3 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Gtf2a1Q99PM3 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Gtf2a1Q99PM3 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Gtf2a1Q99PM3 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Gtf2a1Q99PM3 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Gtf2a1Q99PM3 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Gtf2a1Q99PM3 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Gtf2a1Q99PM3 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Gtf2a1Q99PM3 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Gtf2a1Q99PM3 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Gtf2a1Q99PM3 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Gtf2a1Q99PM3 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Gtf2a1Q99PM3 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Gtf2a1Q99PM3 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Gtf2a1Q99PM3 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Gtf2a1Q99PM3 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.6
Gtf2a1Q99PM3 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Gtf2a1Q99PM3 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Gtf2a1Q99PM3 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Gtf2a1Q99PM3 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Gtf2a1Q99PM3 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Gtf2a1Q99PM3 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Gtf2a1Q99PM3 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Gtf2a1Q99PM3 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Gtf2a1Q99PM3 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Gtf2a1Q99PM3 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Gtf2a1Q99PM3 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Gtf2a1Q99PM3 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Gtf2a1Q99PM3 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Gtf2a1Q99PM3 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Gtf2a1Q99PM3 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Gtf2a1Q99PM3 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Gtf2a1Q99PM3 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Gtf2a1Q99PM3 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Gtf2a1Q99PM3 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Gtf2a1Q99PM3 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Gtf2a1Q99PM3 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Gtf2a1Q99PM3 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Gtf2a1Q99PM3 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Gtf2a1Q99PM3 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Gtf2a1Q99PM3 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Gtf2a1Q99PM3 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Gtf2a1Q99PM3 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Gtf2a1Q99PM3 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Gtf2a1Q99PM3 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Gtf2a1Q99PM3 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Gtf2a1Q99PM3 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Gtf2a1Q99PM3 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Gtf2a1Q99PM3 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Gtf2a1Q99PM3 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Gtf2a1Q99PM3 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Gtf2a1Q99PM3 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Gtf2a1Q99PM3 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Gtf2a1Q99PM3 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Gtf2a1Q99PM3 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Gtf2a1Q99PM3 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Gtf2a1Q99PM3 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Gtf2a1Q99PM3 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Gtf2a1Q99PM3 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Gtf2a1Q99PM3 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Gtf2a1Q99PM3 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Gtf2a1Q99PM3 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
Gtf2a1Q99PM3 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Gtf2a1Q99PM3 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Gtf2a1Q99PM3 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Gtf2a1Q99PM3 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Gtf2a1Q99PM3 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Gtf2a1Q99PM3 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Gtf2a1Q99PM3 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Gtf2a1Q99PM3 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Gtf2a1Q99PM3 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Gtf2a1Q99PM3 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Gtf2a1Q99PM3 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Gtf2a1Q99PM3 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Gtf2a1Q99PM3 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Gtf2a1Q99PM3 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Gtf2a1Q99PM3 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Gtf2a1Q99PM3 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Gtf2a1Q99PM3 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Gtf2a1Q99PM3 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Gtf2a1Q99PM3 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Gtf2a1Q99PM3 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms