Protein–RNA interactions for Protein: Q99PE9

Arl4d, ADP-ribosylation factor-like protein 4D, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arl4dQ99PE9 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Arl4dQ99PE9 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Arl4dQ99PE9 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Arl4dQ99PE9 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Arl4dQ99PE9 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Arl4dQ99PE9 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Arl4dQ99PE9 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Arl4dQ99PE9 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Arl4dQ99PE9 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Arl4dQ99PE9 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Arl4dQ99PE9 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Arl4dQ99PE9 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Arl4dQ99PE9 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Arl4dQ99PE9 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Arl4dQ99PE9 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Arl4dQ99PE9 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Arl4dQ99PE9 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Arl4dQ99PE9 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Arl4dQ99PE9 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Arl4dQ99PE9 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Arl4dQ99PE9 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Arl4dQ99PE9 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Arl4dQ99PE9 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Arl4dQ99PE9 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Arl4dQ99PE9 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Arl4dQ99PE9 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Arl4dQ99PE9 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Arl4dQ99PE9 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Arl4dQ99PE9 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Arl4dQ99PE9 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Arl4dQ99PE9 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Arl4dQ99PE9 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Arl4dQ99PE9 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Arl4dQ99PE9 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Arl4dQ99PE9 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Arl4dQ99PE9 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Arl4dQ99PE9 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Arl4dQ99PE9 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Arl4dQ99PE9 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Arl4dQ99PE9 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Arl4dQ99PE9 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Arl4dQ99PE9 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Arl4dQ99PE9 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Arl4dQ99PE9 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Arl4dQ99PE9 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Arl4dQ99PE9 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Arl4dQ99PE9 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Arl4dQ99PE9 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Arl4dQ99PE9 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Arl4dQ99PE9 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Arl4dQ99PE9 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Arl4dQ99PE9 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Arl4dQ99PE9 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Arl4dQ99PE9 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Arl4dQ99PE9 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Arl4dQ99PE9 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Arl4dQ99PE9 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Arl4dQ99PE9 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Arl4dQ99PE9 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Arl4dQ99PE9 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Arl4dQ99PE9 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Arl4dQ99PE9 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Arl4dQ99PE9 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Arl4dQ99PE9 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Arl4dQ99PE9 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Arl4dQ99PE9 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Arl4dQ99PE9 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Arl4dQ99PE9 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Arl4dQ99PE9 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Arl4dQ99PE9 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Arl4dQ99PE9 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Arl4dQ99PE9 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Arl4dQ99PE9 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Arl4dQ99PE9 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Arl4dQ99PE9 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Arl4dQ99PE9 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Arl4dQ99PE9 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Arl4dQ99PE9 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Arl4dQ99PE9 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Arl4dQ99PE9 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Arl4dQ99PE9 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Arl4dQ99PE9 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Arl4dQ99PE9 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Arl4dQ99PE9 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Arl4dQ99PE9 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Arl4dQ99PE9 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Arl4dQ99PE9 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Arl4dQ99PE9 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Arl4dQ99PE9 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Arl4dQ99PE9 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Arl4dQ99PE9 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Arl4dQ99PE9 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Arl4dQ99PE9 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Arl4dQ99PE9 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Arl4dQ99PE9 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Arl4dQ99PE9 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Arl4dQ99PE9 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Arl4dQ99PE9 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Arl4dQ99PE9 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Arl4dQ99PE9 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.1 ms