Protein–RNA interactions for Protein: Q99NH8

Trem2, Triggering receptor expressed on myeloid cells 2, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trem2Q99NH8 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Trem2Q99NH8 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Trem2Q99NH8 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Trem2Q99NH8 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Trem2Q99NH8 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Trem2Q99NH8 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Trem2Q99NH8 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Trem2Q99NH8 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Trem2Q99NH8 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Trem2Q99NH8 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Trem2Q99NH8 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Trem2Q99NH8 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Trem2Q99NH8 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Trem2Q99NH8 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Trem2Q99NH8 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Trem2Q99NH8 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Trem2Q99NH8 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Trem2Q99NH8 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Trem2Q99NH8 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Trem2Q99NH8 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Trem2Q99NH8 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Trem2Q99NH8 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Trem2Q99NH8 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Trem2Q99NH8 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Trem2Q99NH8 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Trem2Q99NH8 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Trem2Q99NH8 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Trem2Q99NH8 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Trem2Q99NH8 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Trem2Q99NH8 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Trem2Q99NH8 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Trem2Q99NH8 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Trem2Q99NH8 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Trem2Q99NH8 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Trem2Q99NH8 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Trem2Q99NH8 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Trem2Q99NH8 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Trem2Q99NH8 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Trem2Q99NH8 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Trem2Q99NH8 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Trem2Q99NH8 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Trem2Q99NH8 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Trem2Q99NH8 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Trem2Q99NH8 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Trem2Q99NH8 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Trem2Q99NH8 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Trem2Q99NH8 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Trem2Q99NH8 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Trem2Q99NH8 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Trem2Q99NH8 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Trem2Q99NH8 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Trem2Q99NH8 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Trem2Q99NH8 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Trem2Q99NH8 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Trem2Q99NH8 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Trem2Q99NH8 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Trem2Q99NH8 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Trem2Q99NH8 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Trem2Q99NH8 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Trem2Q99NH8 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Trem2Q99NH8 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Trem2Q99NH8 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Trem2Q99NH8 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Trem2Q99NH8 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Trem2Q99NH8 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Trem2Q99NH8 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Trem2Q99NH8 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Trem2Q99NH8 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Trem2Q99NH8 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Trem2Q99NH8 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Trem2Q99NH8 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Trem2Q99NH8 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Trem2Q99NH8 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Trem2Q99NH8 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Trem2Q99NH8 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Trem2Q99NH8 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Trem2Q99NH8 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Trem2Q99NH8 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Trem2Q99NH8 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Trem2Q99NH8 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Trem2Q99NH8 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Trem2Q99NH8 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Trem2Q99NH8 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Trem2Q99NH8 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Trem2Q99NH8 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Trem2Q99NH8 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Trem2Q99NH8 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Trem2Q99NH8 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Trem2Q99NH8 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trem2Q99NH8 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trem2Q99NH8 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trem2Q99NH8 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Trem2Q99NH8 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trem2Q99NH8 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trem2Q99NH8 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trem2Q99NH8 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trem2Q99NH8 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Trem2Q99NH8 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Trem2Q99NH8 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Trem2Q99NH8 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.6 ms