Protein–RNA interactions for Protein: Q99NF2

Nsmf, NMDA receptor synaptonuclear signaling and neuronal migration factor, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NsmfQ99NF2 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
NsmfQ99NF2 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
NsmfQ99NF2 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
NsmfQ99NF2 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
NsmfQ99NF2 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NsmfQ99NF2 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NsmfQ99NF2 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NsmfQ99NF2 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
NsmfQ99NF2 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
NsmfQ99NF2 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NsmfQ99NF2 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NsmfQ99NF2 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
NsmfQ99NF2 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
NsmfQ99NF2 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
NsmfQ99NF2 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NsmfQ99NF2 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NsmfQ99NF2 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
NsmfQ99NF2 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
NsmfQ99NF2 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
NsmfQ99NF2 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
NsmfQ99NF2 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
NsmfQ99NF2 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
NsmfQ99NF2 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
NsmfQ99NF2 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NsmfQ99NF2 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
NsmfQ99NF2 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
NsmfQ99NF2 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NsmfQ99NF2 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NsmfQ99NF2 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
NsmfQ99NF2 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
NsmfQ99NF2 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
NsmfQ99NF2 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.96■■□□□ 1.91
NsmfQ99NF2 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
NsmfQ99NF2 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
NsmfQ99NF2 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
NsmfQ99NF2 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
NsmfQ99NF2 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
NsmfQ99NF2 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.9
NsmfQ99NF2 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
NsmfQ99NF2 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
NsmfQ99NF2 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
NsmfQ99NF2 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
NsmfQ99NF2 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC26.94■■□□□ 1.9
NsmfQ99NF2 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
NsmfQ99NF2 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
NsmfQ99NF2 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
NsmfQ99NF2 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
NsmfQ99NF2 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
NsmfQ99NF2 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
NsmfQ99NF2 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
NsmfQ99NF2 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
NsmfQ99NF2 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
NsmfQ99NF2 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
NsmfQ99NF2 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
NsmfQ99NF2 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
NsmfQ99NF2 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
NsmfQ99NF2 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
NsmfQ99NF2 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
NsmfQ99NF2 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
NsmfQ99NF2 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
NsmfQ99NF2 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
NsmfQ99NF2 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
NsmfQ99NF2 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
NsmfQ99NF2 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
NsmfQ99NF2 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
NsmfQ99NF2 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
NsmfQ99NF2 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
NsmfQ99NF2 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NsmfQ99NF2 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NsmfQ99NF2 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
NsmfQ99NF2 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
NsmfQ99NF2 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
NsmfQ99NF2 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NsmfQ99NF2 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
NsmfQ99NF2 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
NsmfQ99NF2 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NsmfQ99NF2 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
NsmfQ99NF2 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NsmfQ99NF2 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
NsmfQ99NF2 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
NsmfQ99NF2 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NsmfQ99NF2 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
NsmfQ99NF2 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
NsmfQ99NF2 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
NsmfQ99NF2 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
NsmfQ99NF2 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
NsmfQ99NF2 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
NsmfQ99NF2 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
NsmfQ99NF2 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
NsmfQ99NF2 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
NsmfQ99NF2 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
NsmfQ99NF2 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
NsmfQ99NF2 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
NsmfQ99NF2 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
NsmfQ99NF2 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
NsmfQ99NF2 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
NsmfQ99NF2 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
NsmfQ99NF2 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
NsmfQ99NF2 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
NsmfQ99NF2 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms