Protein–RNA interactions for Protein: Q99NB3

Tcam1, Cell adhesion molecule TCAM-1, mousemouse

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcam1Q99NB3 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tcam1Q99NB3 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tcam1Q99NB3 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tcam1Q99NB3 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tcam1Q99NB3 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tcam1Q99NB3 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tcam1Q99NB3 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tcam1Q99NB3 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tcam1Q99NB3 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Tcam1Q99NB3 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Tcam1Q99NB3 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tcam1Q99NB3 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tcam1Q99NB3 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tcam1Q99NB3 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tcam1Q99NB3 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Tcam1Q99NB3 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tcam1Q99NB3 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tcam1Q99NB3 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Tcam1Q99NB3 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Tcam1Q99NB3 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Tcam1Q99NB3 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Tcam1Q99NB3 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tcam1Q99NB3 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tcam1Q99NB3 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tcam1Q99NB3 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tcam1Q99NB3 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tcam1Q99NB3 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tcam1Q99NB3 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tcam1Q99NB3 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tcam1Q99NB3 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tcam1Q99NB3 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tcam1Q99NB3 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tcam1Q99NB3 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tcam1Q99NB3 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tcam1Q99NB3 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tcam1Q99NB3 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tcam1Q99NB3 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tcam1Q99NB3 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tcam1Q99NB3 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tcam1Q99NB3 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tcam1Q99NB3 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tcam1Q99NB3 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tcam1Q99NB3 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tcam1Q99NB3 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Tcam1Q99NB3 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tcam1Q99NB3 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tcam1Q99NB3 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tcam1Q99NB3 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Tcam1Q99NB3 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tcam1Q99NB3 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tcam1Q99NB3 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tcam1Q99NB3 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tcam1Q99NB3 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tcam1Q99NB3 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tcam1Q99NB3 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Tcam1Q99NB3 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tcam1Q99NB3 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tcam1Q99NB3 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tcam1Q99NB3 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tcam1Q99NB3 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tcam1Q99NB3 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tcam1Q99NB3 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tcam1Q99NB3 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tcam1Q99NB3 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tcam1Q99NB3 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tcam1Q99NB3 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Tcam1Q99NB3 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tcam1Q99NB3 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tcam1Q99NB3 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tcam1Q99NB3 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tcam1Q99NB3 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tcam1Q99NB3 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tcam1Q99NB3 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tcam1Q99NB3 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tcam1Q99NB3 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tcam1Q99NB3 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tcam1Q99NB3 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tcam1Q99NB3 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tcam1Q99NB3 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tcam1Q99NB3 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tcam1Q99NB3 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tcam1Q99NB3 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tcam1Q99NB3 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tcam1Q99NB3 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tcam1Q99NB3 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tcam1Q99NB3 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tcam1Q99NB3 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tcam1Q99NB3 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tcam1Q99NB3 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tcam1Q99NB3 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tcam1Q99NB3 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tcam1Q99NB3 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tcam1Q99NB3 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tcam1Q99NB3 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tcam1Q99NB3 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tcam1Q99NB3 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Tcam1Q99NB3 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tcam1Q99NB3 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tcam1Q99NB3 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tcam1Q99NB3 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 97.5 ms