Protein–RNA interactions for Protein: Q99N09

Ms4a6b, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 6B, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a6bQ99N09 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ms4a6bQ99N09 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ms4a6bQ99N09 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ms4a6bQ99N09 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ms4a6bQ99N09 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ms4a6bQ99N09 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ms4a6bQ99N09 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ms4a6bQ99N09 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ms4a6bQ99N09 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ms4a6bQ99N09 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ms4a6bQ99N09 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ms4a6bQ99N09 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ms4a6bQ99N09 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ms4a6bQ99N09 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ms4a6bQ99N09 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Ms4a6bQ99N09 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Ms4a6bQ99N09 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ms4a6bQ99N09 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ms4a6bQ99N09 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ms4a6bQ99N09 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ms4a6bQ99N09 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ms4a6bQ99N09 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ms4a6bQ99N09 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ms4a6bQ99N09 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ms4a6bQ99N09 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ms4a6bQ99N09 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ms4a6bQ99N09 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ms4a6bQ99N09 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ms4a6bQ99N09 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ms4a6bQ99N09 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ms4a6bQ99N09 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ms4a6bQ99N09 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ms4a6bQ99N09 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ms4a6bQ99N09 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ms4a6bQ99N09 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ms4a6bQ99N09 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ms4a6bQ99N09 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ms4a6bQ99N09 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ms4a6bQ99N09 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ms4a6bQ99N09 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ms4a6bQ99N09 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ms4a6bQ99N09 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ms4a6bQ99N09 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ms4a6bQ99N09 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ms4a6bQ99N09 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ms4a6bQ99N09 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ms4a6bQ99N09 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ms4a6bQ99N09 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ms4a6bQ99N09 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ms4a6bQ99N09 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ms4a6bQ99N09 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ms4a6bQ99N09 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ms4a6bQ99N09 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ms4a6bQ99N09 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ms4a6bQ99N09 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ms4a6bQ99N09 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ms4a6bQ99N09 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ms4a6bQ99N09 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ms4a6bQ99N09 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ms4a6bQ99N09 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ms4a6bQ99N09 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ms4a6bQ99N09 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ms4a6bQ99N09 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ms4a6bQ99N09 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ms4a6bQ99N09 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ms4a6bQ99N09 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ms4a6bQ99N09 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ms4a6bQ99N09 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ms4a6bQ99N09 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ms4a6bQ99N09 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Ms4a6bQ99N09 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ms4a6bQ99N09 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ms4a6bQ99N09 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ms4a6bQ99N09 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Ms4a6bQ99N09 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ms4a6bQ99N09 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ms4a6bQ99N09 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ms4a6bQ99N09 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ms4a6bQ99N09 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ms4a6bQ99N09 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ms4a6bQ99N09 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ms4a6bQ99N09 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ms4a6bQ99N09 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ms4a6bQ99N09 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ms4a6bQ99N09 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ms4a6bQ99N09 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ms4a6bQ99N09 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ms4a6bQ99N09 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ms4a6bQ99N09 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ms4a6bQ99N09 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ms4a6bQ99N09 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ms4a6bQ99N09 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ms4a6bQ99N09 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ms4a6bQ99N09 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ms4a6bQ99N09 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ms4a6bQ99N09 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ms4a6bQ99N09 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ms4a6bQ99N09 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ms4a6bQ99N09 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ms4a6bQ99N09 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.2 ms