Protein–RNA interactions for Protein: Q99K46

Usp11, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 11, mousemouse

Predictions only

Length 921 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp11Q99K46 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Usp11Q99K46 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Usp11Q99K46 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Usp11Q99K46 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Usp11Q99K46 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Usp11Q99K46 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Usp11Q99K46 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Usp11Q99K46 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Usp11Q99K46 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Usp11Q99K46 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Usp11Q99K46 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Usp11Q99K46 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Usp11Q99K46 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Usp11Q99K46 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Usp11Q99K46 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Usp11Q99K46 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Usp11Q99K46 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Usp11Q99K46 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Usp11Q99K46 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Usp11Q99K46 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Usp11Q99K46 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Usp11Q99K46 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Usp11Q99K46 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Usp11Q99K46 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Usp11Q99K46 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Usp11Q99K46 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Usp11Q99K46 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Usp11Q99K46 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Usp11Q99K46 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Usp11Q99K46 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Usp11Q99K46 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Usp11Q99K46 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Usp11Q99K46 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Usp11Q99K46 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Usp11Q99K46 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Usp11Q99K46 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Usp11Q99K46 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Usp11Q99K46 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Usp11Q99K46 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Usp11Q99K46 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Usp11Q99K46 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Usp11Q99K46 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Usp11Q99K46 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Usp11Q99K46 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Usp11Q99K46 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Usp11Q99K46 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Usp11Q99K46 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Usp11Q99K46 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Usp11Q99K46 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Usp11Q99K46 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Usp11Q99K46 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Usp11Q99K46 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Usp11Q99K46 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Usp11Q99K46 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Usp11Q99K46 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Usp11Q99K46 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Usp11Q99K46 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Usp11Q99K46 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Usp11Q99K46 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Usp11Q99K46 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Usp11Q99K46 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
Usp11Q99K46 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Usp11Q99K46 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Usp11Q99K46 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Usp11Q99K46 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Usp11Q99K46 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Usp11Q99K46 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Usp11Q99K46 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Usp11Q99K46 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Usp11Q99K46 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Usp11Q99K46 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Usp11Q99K46 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Usp11Q99K46 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Usp11Q99K46 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Usp11Q99K46 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Usp11Q99K46 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Usp11Q99K46 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Usp11Q99K46 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Usp11Q99K46 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Usp11Q99K46 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Usp11Q99K46 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Usp11Q99K46 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Usp11Q99K46 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Usp11Q99K46 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Usp11Q99K46 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Usp11Q99K46 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Usp11Q99K46 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Usp11Q99K46 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Usp11Q99K46 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Usp11Q99K46 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Usp11Q99K46 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Usp11Q99K46 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Usp11Q99K46 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Usp11Q99K46 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Usp11Q99K46 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Usp11Q99K46 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Usp11Q99K46 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Usp11Q99K46 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Usp11Q99K46 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Usp11Q99K46 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms