Protein–RNA interactions for Protein: Q99JZ0

Sdcbp2, Syntenin-2, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdcbp2Q99JZ0 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Sdcbp2Q99JZ0 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Sdcbp2Q99JZ0 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Sdcbp2Q99JZ0 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Sdcbp2Q99JZ0 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Sdcbp2Q99JZ0 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Sdcbp2Q99JZ0 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Sdcbp2Q99JZ0 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Sdcbp2Q99JZ0 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Sdcbp2Q99JZ0 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Sdcbp2Q99JZ0 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Sdcbp2Q99JZ0 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Sdcbp2Q99JZ0 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Sdcbp2Q99JZ0 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Sdcbp2Q99JZ0 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Sdcbp2Q99JZ0 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Sdcbp2Q99JZ0 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Sdcbp2Q99JZ0 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Sdcbp2Q99JZ0 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Sdcbp2Q99JZ0 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Sdcbp2Q99JZ0 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Sdcbp2Q99JZ0 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Sdcbp2Q99JZ0 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Sdcbp2Q99JZ0 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Sdcbp2Q99JZ0 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Sdcbp2Q99JZ0 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Sdcbp2Q99JZ0 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Sdcbp2Q99JZ0 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Sdcbp2Q99JZ0 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Sdcbp2Q99JZ0 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Sdcbp2Q99JZ0 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Sdcbp2Q99JZ0 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Sdcbp2Q99JZ0 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Sdcbp2Q99JZ0 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Sdcbp2Q99JZ0 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Sdcbp2Q99JZ0 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Sdcbp2Q99JZ0 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Sdcbp2Q99JZ0 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Sdcbp2Q99JZ0 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Sdcbp2Q99JZ0 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Sdcbp2Q99JZ0 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Sdcbp2Q99JZ0 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Sdcbp2Q99JZ0 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Sdcbp2Q99JZ0 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Sdcbp2Q99JZ0 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Sdcbp2Q99JZ0 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Sdcbp2Q99JZ0 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Sdcbp2Q99JZ0 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Sdcbp2Q99JZ0 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Sdcbp2Q99JZ0 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Sdcbp2Q99JZ0 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Sdcbp2Q99JZ0 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Sdcbp2Q99JZ0 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Sdcbp2Q99JZ0 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Sdcbp2Q99JZ0 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Sdcbp2Q99JZ0 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Sdcbp2Q99JZ0 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Sdcbp2Q99JZ0 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Sdcbp2Q99JZ0 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Sdcbp2Q99JZ0 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Sdcbp2Q99JZ0 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Sdcbp2Q99JZ0 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Sdcbp2Q99JZ0 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Sdcbp2Q99JZ0 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Sdcbp2Q99JZ0 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Sdcbp2Q99JZ0 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Sdcbp2Q99JZ0 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Sdcbp2Q99JZ0 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Sdcbp2Q99JZ0 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Sdcbp2Q99JZ0 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Sdcbp2Q99JZ0 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Sdcbp2Q99JZ0 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Sdcbp2Q99JZ0 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Sdcbp2Q99JZ0 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Sdcbp2Q99JZ0 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Sdcbp2Q99JZ0 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Sdcbp2Q99JZ0 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Sdcbp2Q99JZ0 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Sdcbp2Q99JZ0 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Sdcbp2Q99JZ0 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Sdcbp2Q99JZ0 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Sdcbp2Q99JZ0 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Sdcbp2Q99JZ0 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Sdcbp2Q99JZ0 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Sdcbp2Q99JZ0 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Sdcbp2Q99JZ0 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Sdcbp2Q99JZ0 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Sdcbp2Q99JZ0 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Sdcbp2Q99JZ0 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Sdcbp2Q99JZ0 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Sdcbp2Q99JZ0 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Sdcbp2Q99JZ0 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Sdcbp2Q99JZ0 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Sdcbp2Q99JZ0 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Sdcbp2Q99JZ0 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Sdcbp2Q99JZ0 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Sdcbp2Q99JZ0 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Sdcbp2Q99JZ0 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Sdcbp2Q99JZ0 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Sdcbp2Q99JZ0 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.9 ms