Protein–RNA interactions for Protein: Q99JY1

Tirap, Toll/interleukin-1 receptor domain-containing adapter protein, mousemouse

Predictions only

Length 241 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TirapQ99JY1 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TirapQ99JY1 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TirapQ99JY1 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TirapQ99JY1 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TirapQ99JY1 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TirapQ99JY1 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TirapQ99JY1 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TirapQ99JY1 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TirapQ99JY1 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TirapQ99JY1 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TirapQ99JY1 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TirapQ99JY1 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TirapQ99JY1 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TirapQ99JY1 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TirapQ99JY1 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TirapQ99JY1 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TirapQ99JY1 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TirapQ99JY1 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TirapQ99JY1 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TirapQ99JY1 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TirapQ99JY1 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TirapQ99JY1 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TirapQ99JY1 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TirapQ99JY1 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TirapQ99JY1 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TirapQ99JY1 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TirapQ99JY1 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TirapQ99JY1 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TirapQ99JY1 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TirapQ99JY1 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TirapQ99JY1 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TirapQ99JY1 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TirapQ99JY1 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TirapQ99JY1 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TirapQ99JY1 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TirapQ99JY1 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TirapQ99JY1 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TirapQ99JY1 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TirapQ99JY1 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TirapQ99JY1 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TirapQ99JY1 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TirapQ99JY1 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TirapQ99JY1 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TirapQ99JY1 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TirapQ99JY1 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TirapQ99JY1 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TirapQ99JY1 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TirapQ99JY1 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TirapQ99JY1 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TirapQ99JY1 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TirapQ99JY1 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TirapQ99JY1 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TirapQ99JY1 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TirapQ99JY1 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TirapQ99JY1 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TirapQ99JY1 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
TirapQ99JY1 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
TirapQ99JY1 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TirapQ99JY1 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TirapQ99JY1 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TirapQ99JY1 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TirapQ99JY1 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TirapQ99JY1 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TirapQ99JY1 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TirapQ99JY1 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TirapQ99JY1 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TirapQ99JY1 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
TirapQ99JY1 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
TirapQ99JY1 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
TirapQ99JY1 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TirapQ99JY1 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TirapQ99JY1 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TirapQ99JY1 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TirapQ99JY1 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TirapQ99JY1 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TirapQ99JY1 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TirapQ99JY1 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TirapQ99JY1 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
TirapQ99JY1 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TirapQ99JY1 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TirapQ99JY1 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TirapQ99JY1 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TirapQ99JY1 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
TirapQ99JY1 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TirapQ99JY1 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TirapQ99JY1 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TirapQ99JY1 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TirapQ99JY1 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TirapQ99JY1 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TirapQ99JY1 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TirapQ99JY1 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TirapQ99JY1 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TirapQ99JY1 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TirapQ99JY1 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TirapQ99JY1 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TirapQ99JY1 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TirapQ99JY1 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TirapQ99JY1 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
TirapQ99JY1 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TirapQ99JY1 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms