Protein–RNA interactions for Protein: Q99J79

Ddb2, DNA damage-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddb2Q99J79 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ddb2Q99J79 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ddb2Q99J79 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ddb2Q99J79 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC19.83■□□□□ 0.76
Ddb2Q99J79 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ddb2Q99J79 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ddb2Q99J79 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ddb2Q99J79 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
Ddb2Q99J79 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ddb2Q99J79 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ddb2Q99J79 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ddb2Q99J79 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ddb2Q99J79 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ddb2Q99J79 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ddb2Q99J79 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ddb2Q99J79 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
Ddb2Q99J79 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ddb2Q99J79 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ddb2Q99J79 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ddb2Q99J79 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ddb2Q99J79 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ddb2Q99J79 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ddb2Q99J79 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ddb2Q99J79 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ddb2Q99J79 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ddb2Q99J79 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ddb2Q99J79 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
Ddb2Q99J79 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ddb2Q99J79 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ddb2Q99J79 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ddb2Q99J79 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ddb2Q99J79 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ddb2Q99J79 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ddb2Q99J79 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
Ddb2Q99J79 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ddb2Q99J79 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
Ddb2Q99J79 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ddb2Q99J79 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ddb2Q99J79 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ddb2Q99J79 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ddb2Q99J79 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ddb2Q99J79 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ddb2Q99J79 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ddb2Q99J79 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ddb2Q99J79 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ddb2Q99J79 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ddb2Q99J79 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
Ddb2Q99J79 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ddb2Q99J79 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ddb2Q99J79 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ddb2Q99J79 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Ddb2Q99J79 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Ddb2Q99J79 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ddb2Q99J79 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ddb2Q99J79 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ddb2Q99J79 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ddb2Q99J79 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ddb2Q99J79 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ddb2Q99J79 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ddb2Q99J79 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ddb2Q99J79 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ddb2Q99J79 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ddb2Q99J79 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ddb2Q99J79 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ddb2Q99J79 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ddb2Q99J79 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ddb2Q99J79 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ddb2Q99J79 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ddb2Q99J79 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ddb2Q99J79 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ddb2Q99J79 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ddb2Q99J79 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ddb2Q99J79 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ddb2Q99J79 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ddb2Q99J79 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ddb2Q99J79 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ddb2Q99J79 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ddb2Q99J79 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ddb2Q99J79 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ddb2Q99J79 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ddb2Q99J79 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ddb2Q99J79 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ddb2Q99J79 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ddb2Q99J79 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
Ddb2Q99J79 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ddb2Q99J79 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ddb2Q99J79 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ddb2Q99J79 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ddb2Q99J79 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ddb2Q99J79 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ddb2Q99J79 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ddb2Q99J79 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ddb2Q99J79 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ddb2Q99J79 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ddb2Q99J79 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ddb2Q99J79 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ddb2Q99J79 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ddb2Q99J79 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ddb2Q99J79 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ddb2Q99J79 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 126.2 ms