Protein–RNA interactions for Protein: Q99J78

Def8, Differentially expressed in FDCP 8, mousemouse

Predictions only

Length 448 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Def8Q99J78 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Def8Q99J78 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Def8Q99J78 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Def8Q99J78 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Def8Q99J78 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Def8Q99J78 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Def8Q99J78 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Def8Q99J78 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Def8Q99J78 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Def8Q99J78 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Def8Q99J78 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Def8Q99J78 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Def8Q99J78 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Def8Q99J78 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Def8Q99J78 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Def8Q99J78 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Def8Q99J78 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Def8Q99J78 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Def8Q99J78 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Def8Q99J78 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Def8Q99J78 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Def8Q99J78 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Def8Q99J78 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Def8Q99J78 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Def8Q99J78 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Def8Q99J78 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Def8Q99J78 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Def8Q99J78 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Def8Q99J78 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Def8Q99J78 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Def8Q99J78 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Def8Q99J78 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Def8Q99J78 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Def8Q99J78 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Def8Q99J78 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Def8Q99J78 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Def8Q99J78 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Def8Q99J78 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Def8Q99J78 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Def8Q99J78 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Def8Q99J78 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Def8Q99J78 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Def8Q99J78 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Def8Q99J78 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Def8Q99J78 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Def8Q99J78 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Def8Q99J78 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Def8Q99J78 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Def8Q99J78 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Def8Q99J78 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Def8Q99J78 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Def8Q99J78 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Def8Q99J78 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Def8Q99J78 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Def8Q99J78 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Def8Q99J78 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Def8Q99J78 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Def8Q99J78 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Def8Q99J78 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Def8Q99J78 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Def8Q99J78 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Def8Q99J78 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Def8Q99J78 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Def8Q99J78 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Def8Q99J78 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Def8Q99J78 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Def8Q99J78 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Def8Q99J78 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Def8Q99J78 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Def8Q99J78 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Def8Q99J78 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Def8Q99J78 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Def8Q99J78 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Def8Q99J78 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Def8Q99J78 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Def8Q99J78 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Def8Q99J78 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Def8Q99J78 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Def8Q99J78 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Def8Q99J78 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Def8Q99J78 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Def8Q99J78 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Def8Q99J78 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Def8Q99J78 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Def8Q99J78 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Def8Q99J78 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Def8Q99J78 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Def8Q99J78 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Def8Q99J78 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Def8Q99J78 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Def8Q99J78 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Def8Q99J78 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Def8Q99J78 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Def8Q99J78 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Def8Q99J78 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Def8Q99J78 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Def8Q99J78 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Def8Q99J78 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Def8Q99J78 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Def8Q99J78 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.4 ms