Protein–RNA interactions for Protein: Q924T3

Xrcc4, DNA repair protein XRCC4, mousemouse

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xrcc4Q924T3 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Xrcc4Q924T3 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Xrcc4Q924T3 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Xrcc4Q924T3 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Xrcc4Q924T3 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
Xrcc4Q924T3 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Xrcc4Q924T3 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Xrcc4Q924T3 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Xrcc4Q924T3 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Xrcc4Q924T3 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Xrcc4Q924T3 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Xrcc4Q924T3 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Xrcc4Q924T3 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
Xrcc4Q924T3 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Xrcc4Q924T3 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Xrcc4Q924T3 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
Xrcc4Q924T3 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Xrcc4Q924T3 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Xrcc4Q924T3 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Xrcc4Q924T3 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Xrcc4Q924T3 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Xrcc4Q924T3 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Xrcc4Q924T3 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Xrcc4Q924T3 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Xrcc4Q924T3 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Xrcc4Q924T3 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Xrcc4Q924T3 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Xrcc4Q924T3 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Xrcc4Q924T3 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Xrcc4Q924T3 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Xrcc4Q924T3 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Xrcc4Q924T3 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Xrcc4Q924T3 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Xrcc4Q924T3 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Xrcc4Q924T3 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Xrcc4Q924T3 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Xrcc4Q924T3 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Xrcc4Q924T3 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Xrcc4Q924T3 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Xrcc4Q924T3 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Xrcc4Q924T3 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Xrcc4Q924T3 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Xrcc4Q924T3 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Xrcc4Q924T3 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Xrcc4Q924T3 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Xrcc4Q924T3 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Xrcc4Q924T3 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Xrcc4Q924T3 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Xrcc4Q924T3 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Xrcc4Q924T3 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Xrcc4Q924T3 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Xrcc4Q924T3 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Xrcc4Q924T3 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Xrcc4Q924T3 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Xrcc4Q924T3 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Xrcc4Q924T3 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Xrcc4Q924T3 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Xrcc4Q924T3 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Xrcc4Q924T3 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Xrcc4Q924T3 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Xrcc4Q924T3 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Xrcc4Q924T3 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
Xrcc4Q924T3 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Xrcc4Q924T3 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Xrcc4Q924T3 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Xrcc4Q924T3 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Xrcc4Q924T3 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Xrcc4Q924T3 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Xrcc4Q924T3 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Xrcc4Q924T3 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Xrcc4Q924T3 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Xrcc4Q924T3 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Xrcc4Q924T3 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Xrcc4Q924T3 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
Xrcc4Q924T3 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Xrcc4Q924T3 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Xrcc4Q924T3 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Xrcc4Q924T3 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Xrcc4Q924T3 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Xrcc4Q924T3 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Xrcc4Q924T3 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Xrcc4Q924T3 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Xrcc4Q924T3 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
Xrcc4Q924T3 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Xrcc4Q924T3 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Xrcc4Q924T3 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Xrcc4Q924T3 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Xrcc4Q924T3 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Xrcc4Q924T3 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Xrcc4Q924T3 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Xrcc4Q924T3 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Xrcc4Q924T3 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Xrcc4Q924T3 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Xrcc4Q924T3 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Xrcc4Q924T3 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Xrcc4Q924T3 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Xrcc4Q924T3 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Xrcc4Q924T3 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Xrcc4Q924T3 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
Xrcc4Q924T3 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms