Protein–RNA interactions for Protein: Q923P0

Col20a1, Collagen alpha-1(XX) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col20a1Q923P0 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Col20a1Q923P0 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Col20a1Q923P0 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Col20a1Q923P0 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Col20a1Q923P0 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Col20a1Q923P0 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Col20a1Q923P0 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Col20a1Q923P0 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Col20a1Q923P0 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Col20a1Q923P0 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Col20a1Q923P0 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Col20a1Q923P0 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Col20a1Q923P0 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Col20a1Q923P0 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Col20a1Q923P0 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Col20a1Q923P0 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Col20a1Q923P0 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Col20a1Q923P0 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Col20a1Q923P0 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Col20a1Q923P0 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Col20a1Q923P0 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Col20a1Q923P0 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Col20a1Q923P0 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Col20a1Q923P0 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Col20a1Q923P0 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Col20a1Q923P0 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Col20a1Q923P0 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Col20a1Q923P0 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Col20a1Q923P0 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Col20a1Q923P0 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
Col20a1Q923P0 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Col20a1Q923P0 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
Col20a1Q923P0 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Col20a1Q923P0 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Col20a1Q923P0 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Col20a1Q923P0 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Col20a1Q923P0 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Col20a1Q923P0 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Col20a1Q923P0 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Col20a1Q923P0 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Col20a1Q923P0 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Col20a1Q923P0 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Col20a1Q923P0 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Col20a1Q923P0 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Col20a1Q923P0 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Col20a1Q923P0 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Col20a1Q923P0 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Col20a1Q923P0 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Col20a1Q923P0 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Col20a1Q923P0 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Col20a1Q923P0 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Col20a1Q923P0 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Col20a1Q923P0 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Col20a1Q923P0 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Col20a1Q923P0 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Col20a1Q923P0 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
Col20a1Q923P0 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Col20a1Q923P0 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Col20a1Q923P0 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Col20a1Q923P0 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Col20a1Q923P0 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Col20a1Q923P0 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Col20a1Q923P0 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Col20a1Q923P0 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Col20a1Q923P0 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Col20a1Q923P0 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Col20a1Q923P0 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Col20a1Q923P0 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Col20a1Q923P0 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Col20a1Q923P0 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Col20a1Q923P0 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Col20a1Q923P0 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Col20a1Q923P0 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Col20a1Q923P0 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Col20a1Q923P0 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Col20a1Q923P0 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Col20a1Q923P0 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Col20a1Q923P0 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Col20a1Q923P0 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Col20a1Q923P0 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
Col20a1Q923P0 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Col20a1Q923P0 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Col20a1Q923P0 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
Col20a1Q923P0 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Col20a1Q923P0 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Col20a1Q923P0 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Col20a1Q923P0 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Col20a1Q923P0 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Col20a1Q923P0 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Col20a1Q923P0 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Col20a1Q923P0 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Col20a1Q923P0 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Col20a1Q923P0 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Col20a1Q923P0 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Col20a1Q923P0 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Col20a1Q923P0 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Col20a1Q923P0 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Col20a1Q923P0 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Col20a1Q923P0 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Col20a1Q923P0 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 101.2 ms