Protein–RNA interactions for Protein: Q922Y1

Ubxn1, UBX domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn1Q922Y1 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ubxn1Q922Y1 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ubxn1Q922Y1 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ubxn1Q922Y1 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ubxn1Q922Y1 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Ubxn1Q922Y1 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Ubxn1Q922Y1 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Ubxn1Q922Y1 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Ubxn1Q922Y1 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Ubxn1Q922Y1 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ubxn1Q922Y1 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ubxn1Q922Y1 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ubxn1Q922Y1 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ubxn1Q922Y1 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ubxn1Q922Y1 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ubxn1Q922Y1 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ubxn1Q922Y1 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Ubxn1Q922Y1 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ubxn1Q922Y1 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ubxn1Q922Y1 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ubxn1Q922Y1 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ubxn1Q922Y1 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ubxn1Q922Y1 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ubxn1Q922Y1 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ubxn1Q922Y1 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ubxn1Q922Y1 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ubxn1Q922Y1 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ubxn1Q922Y1 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Ubxn1Q922Y1 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ubxn1Q922Y1 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ubxn1Q922Y1 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ubxn1Q922Y1 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ubxn1Q922Y1 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ubxn1Q922Y1 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ubxn1Q922Y1 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ubxn1Q922Y1 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ubxn1Q922Y1 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ubxn1Q922Y1 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ubxn1Q922Y1 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ubxn1Q922Y1 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ubxn1Q922Y1 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ubxn1Q922Y1 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ubxn1Q922Y1 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ubxn1Q922Y1 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ubxn1Q922Y1 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ubxn1Q922Y1 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ubxn1Q922Y1 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ubxn1Q922Y1 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ubxn1Q922Y1 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ubxn1Q922Y1 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ubxn1Q922Y1 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ubxn1Q922Y1 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ubxn1Q922Y1 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ubxn1Q922Y1 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ubxn1Q922Y1 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ubxn1Q922Y1 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ubxn1Q922Y1 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ubxn1Q922Y1 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ubxn1Q922Y1 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ubxn1Q922Y1 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ubxn1Q922Y1 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ubxn1Q922Y1 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ubxn1Q922Y1 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ubxn1Q922Y1 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ubxn1Q922Y1 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ubxn1Q922Y1 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ubxn1Q922Y1 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ubxn1Q922Y1 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ubxn1Q922Y1 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ubxn1Q922Y1 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ubxn1Q922Y1 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ubxn1Q922Y1 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ubxn1Q922Y1 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ubxn1Q922Y1 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ubxn1Q922Y1 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ubxn1Q922Y1 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ubxn1Q922Y1 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ubxn1Q922Y1 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ubxn1Q922Y1 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ubxn1Q922Y1 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ubxn1Q922Y1 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Ubxn1Q922Y1 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ubxn1Q922Y1 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ubxn1Q922Y1 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ubxn1Q922Y1 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ubxn1Q922Y1 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Ubxn1Q922Y1 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ubxn1Q922Y1 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ubxn1Q922Y1 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ubxn1Q922Y1 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ubxn1Q922Y1 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ubxn1Q922Y1 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ubxn1Q922Y1 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ubxn1Q922Y1 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ubxn1Q922Y1 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ubxn1Q922Y1 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ubxn1Q922Y1 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ubxn1Q922Y1 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ubxn1Q922Y1 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ubxn1Q922Y1 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms