Protein–RNA interactions for Protein: Q920A7

Afg3l1, AFG3-like protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 789 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Afg3l1Q920A7 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Afg3l1Q920A7 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Afg3l1Q920A7 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Afg3l1Q920A7 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Afg3l1Q920A7 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Afg3l1Q920A7 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Afg3l1Q920A7 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Afg3l1Q920A7 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Afg3l1Q920A7 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Afg3l1Q920A7 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Afg3l1Q920A7 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Afg3l1Q920A7 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Afg3l1Q920A7 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Afg3l1Q920A7 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Afg3l1Q920A7 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Afg3l1Q920A7 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Afg3l1Q920A7 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Afg3l1Q920A7 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Afg3l1Q920A7 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Afg3l1Q920A7 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Afg3l1Q920A7 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Afg3l1Q920A7 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Afg3l1Q920A7 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Afg3l1Q920A7 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Afg3l1Q920A7 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Afg3l1Q920A7 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Afg3l1Q920A7 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Afg3l1Q920A7 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Afg3l1Q920A7 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Afg3l1Q920A7 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Afg3l1Q920A7 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Afg3l1Q920A7 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Afg3l1Q920A7 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Afg3l1Q920A7 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Afg3l1Q920A7 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Afg3l1Q920A7 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Afg3l1Q920A7 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Afg3l1Q920A7 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Afg3l1Q920A7 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Afg3l1Q920A7 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Afg3l1Q920A7 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Afg3l1Q920A7 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Afg3l1Q920A7 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Afg3l1Q920A7 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Afg3l1Q920A7 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Afg3l1Q920A7 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Afg3l1Q920A7 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Afg3l1Q920A7 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Afg3l1Q920A7 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Afg3l1Q920A7 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Afg3l1Q920A7 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Afg3l1Q920A7 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Afg3l1Q920A7 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Afg3l1Q920A7 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Afg3l1Q920A7 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Afg3l1Q920A7 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Afg3l1Q920A7 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Afg3l1Q920A7 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Afg3l1Q920A7 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Afg3l1Q920A7 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Afg3l1Q920A7 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Afg3l1Q920A7 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Afg3l1Q920A7 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Afg3l1Q920A7 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Afg3l1Q920A7 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Afg3l1Q920A7 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Afg3l1Q920A7 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Afg3l1Q920A7 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Afg3l1Q920A7 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Afg3l1Q920A7 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Afg3l1Q920A7 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Afg3l1Q920A7 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Afg3l1Q920A7 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Afg3l1Q920A7 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Afg3l1Q920A7 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Afg3l1Q920A7 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Afg3l1Q920A7 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Afg3l1Q920A7 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Afg3l1Q920A7 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Afg3l1Q920A7 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Afg3l1Q920A7 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Afg3l1Q920A7 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Afg3l1Q920A7 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Afg3l1Q920A7 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Afg3l1Q920A7 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Afg3l1Q920A7 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Afg3l1Q920A7 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Afg3l1Q920A7 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Afg3l1Q920A7 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Afg3l1Q920A7 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Afg3l1Q920A7 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Afg3l1Q920A7 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Afg3l1Q920A7 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Afg3l1Q920A7 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Afg3l1Q920A7 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Afg3l1Q920A7 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Afg3l1Q920A7 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Afg3l1Q920A7 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Afg3l1Q920A7 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Afg3l1Q920A7 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.8 ms