Protein–RNA interactions for Protein: Q91Z38

Ttc1, Tetratricopeptide repeat protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc1Q91Z38 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ttc1Q91Z38 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ttc1Q91Z38 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ttc1Q91Z38 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Ttc1Q91Z38 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ttc1Q91Z38 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ttc1Q91Z38 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ttc1Q91Z38 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ttc1Q91Z38 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ttc1Q91Z38 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ttc1Q91Z38 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ttc1Q91Z38 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ttc1Q91Z38 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ttc1Q91Z38 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ttc1Q91Z38 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ttc1Q91Z38 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ttc1Q91Z38 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ttc1Q91Z38 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ttc1Q91Z38 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Ttc1Q91Z38 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ttc1Q91Z38 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ttc1Q91Z38 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ttc1Q91Z38 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Ttc1Q91Z38 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Ttc1Q91Z38 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ttc1Q91Z38 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ttc1Q91Z38 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ttc1Q91Z38 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ttc1Q91Z38 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ttc1Q91Z38 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ttc1Q91Z38 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ttc1Q91Z38 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Ttc1Q91Z38 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ttc1Q91Z38 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ttc1Q91Z38 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ttc1Q91Z38 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ttc1Q91Z38 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ttc1Q91Z38 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ttc1Q91Z38 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ttc1Q91Z38 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ttc1Q91Z38 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ttc1Q91Z38 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ttc1Q91Z38 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ttc1Q91Z38 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ttc1Q91Z38 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ttc1Q91Z38 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ttc1Q91Z38 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ttc1Q91Z38 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ttc1Q91Z38 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ttc1Q91Z38 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Ttc1Q91Z38 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Ttc1Q91Z38 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ttc1Q91Z38 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ttc1Q91Z38 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ttc1Q91Z38 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ttc1Q91Z38 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ttc1Q91Z38 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ttc1Q91Z38 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Ttc1Q91Z38 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ttc1Q91Z38 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Ttc1Q91Z38 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ttc1Q91Z38 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Ttc1Q91Z38 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ttc1Q91Z38 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ttc1Q91Z38 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ttc1Q91Z38 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ttc1Q91Z38 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ttc1Q91Z38 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ttc1Q91Z38 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ttc1Q91Z38 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ttc1Q91Z38 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ttc1Q91Z38 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ttc1Q91Z38 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ttc1Q91Z38 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ttc1Q91Z38 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ttc1Q91Z38 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ttc1Q91Z38 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ttc1Q91Z38 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Ttc1Q91Z38 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Ttc1Q91Z38 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Ttc1Q91Z38 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ttc1Q91Z38 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ttc1Q91Z38 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ttc1Q91Z38 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ttc1Q91Z38 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ttc1Q91Z38 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ttc1Q91Z38 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ttc1Q91Z38 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ttc1Q91Z38 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ttc1Q91Z38 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ttc1Q91Z38 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Ttc1Q91Z38 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ttc1Q91Z38 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ttc1Q91Z38 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ttc1Q91Z38 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ttc1Q91Z38 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ttc1Q91Z38 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ttc1Q91Z38 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ttc1Q91Z38 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ttc1Q91Z38 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms