Protein–RNA interactions for Protein: Q91YR7

Prpf6, Pre-mRNA-processing factor 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 941 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf6Q91YR7 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Prpf6Q91YR7 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Prpf6Q91YR7 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Prpf6Q91YR7 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Prpf6Q91YR7 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Prpf6Q91YR7 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Prpf6Q91YR7 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Prpf6Q91YR7 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Prpf6Q91YR7 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Prpf6Q91YR7 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Prpf6Q91YR7 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Prpf6Q91YR7 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Prpf6Q91YR7 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Prpf6Q91YR7 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Prpf6Q91YR7 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Prpf6Q91YR7 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Prpf6Q91YR7 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Prpf6Q91YR7 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Prpf6Q91YR7 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Prpf6Q91YR7 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Prpf6Q91YR7 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Prpf6Q91YR7 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Prpf6Q91YR7 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Prpf6Q91YR7 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Prpf6Q91YR7 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Prpf6Q91YR7 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Prpf6Q91YR7 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Prpf6Q91YR7 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Prpf6Q91YR7 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Prpf6Q91YR7 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Prpf6Q91YR7 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Prpf6Q91YR7 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Prpf6Q91YR7 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Prpf6Q91YR7 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Prpf6Q91YR7 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Prpf6Q91YR7 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Prpf6Q91YR7 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Prpf6Q91YR7 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Prpf6Q91YR7 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Prpf6Q91YR7 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Prpf6Q91YR7 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Prpf6Q91YR7 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Prpf6Q91YR7 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Prpf6Q91YR7 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Prpf6Q91YR7 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Prpf6Q91YR7 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Prpf6Q91YR7 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Prpf6Q91YR7 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Prpf6Q91YR7 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Prpf6Q91YR7 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Prpf6Q91YR7 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Prpf6Q91YR7 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Prpf6Q91YR7 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Prpf6Q91YR7 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Prpf6Q91YR7 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Prpf6Q91YR7 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Prpf6Q91YR7 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Prpf6Q91YR7 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Prpf6Q91YR7 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Prpf6Q91YR7 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Prpf6Q91YR7 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Prpf6Q91YR7 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Prpf6Q91YR7 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Prpf6Q91YR7 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Prpf6Q91YR7 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Prpf6Q91YR7 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Prpf6Q91YR7 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Prpf6Q91YR7 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Prpf6Q91YR7 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Prpf6Q91YR7 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Prpf6Q91YR7 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Prpf6Q91YR7 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Prpf6Q91YR7 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Prpf6Q91YR7 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Prpf6Q91YR7 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Prpf6Q91YR7 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
Prpf6Q91YR7 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Prpf6Q91YR7 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Prpf6Q91YR7 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Prpf6Q91YR7 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Prpf6Q91YR7 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Prpf6Q91YR7 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Prpf6Q91YR7 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Prpf6Q91YR7 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Prpf6Q91YR7 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Prpf6Q91YR7 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Prpf6Q91YR7 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Prpf6Q91YR7 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Prpf6Q91YR7 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Prpf6Q91YR7 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Prpf6Q91YR7 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Prpf6Q91YR7 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Prpf6Q91YR7 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Prpf6Q91YR7 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Prpf6Q91YR7 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Prpf6Q91YR7 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Prpf6Q91YR7 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Prpf6Q91YR7 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Prpf6Q91YR7 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Prpf6Q91YR7 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms