Protein–RNA interactions for Protein: Q91WC7

Nipal2, NIPA-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 383 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nipal2Q91WC7 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nipal2Q91WC7 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nipal2Q91WC7 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nipal2Q91WC7 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nipal2Q91WC7 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nipal2Q91WC7 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nipal2Q91WC7 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nipal2Q91WC7 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nipal2Q91WC7 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nipal2Q91WC7 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nipal2Q91WC7 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nipal2Q91WC7 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nipal2Q91WC7 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nipal2Q91WC7 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nipal2Q91WC7 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nipal2Q91WC7 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nipal2Q91WC7 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nipal2Q91WC7 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Nipal2Q91WC7 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nipal2Q91WC7 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Nipal2Q91WC7 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Nipal2Q91WC7 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nipal2Q91WC7 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Nipal2Q91WC7 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Nipal2Q91WC7 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nipal2Q91WC7 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nipal2Q91WC7 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nipal2Q91WC7 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nipal2Q91WC7 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nipal2Q91WC7 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nipal2Q91WC7 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nipal2Q91WC7 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nipal2Q91WC7 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nipal2Q91WC7 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nipal2Q91WC7 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nipal2Q91WC7 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nipal2Q91WC7 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nipal2Q91WC7 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nipal2Q91WC7 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nipal2Q91WC7 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nipal2Q91WC7 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nipal2Q91WC7 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nipal2Q91WC7 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nipal2Q91WC7 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nipal2Q91WC7 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nipal2Q91WC7 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nipal2Q91WC7 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nipal2Q91WC7 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nipal2Q91WC7 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nipal2Q91WC7 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nipal2Q91WC7 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nipal2Q91WC7 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nipal2Q91WC7 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nipal2Q91WC7 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nipal2Q91WC7 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nipal2Q91WC7 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nipal2Q91WC7 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nipal2Q91WC7 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nipal2Q91WC7 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nipal2Q91WC7 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nipal2Q91WC7 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nipal2Q91WC7 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nipal2Q91WC7 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nipal2Q91WC7 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nipal2Q91WC7 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nipal2Q91WC7 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nipal2Q91WC7 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nipal2Q91WC7 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nipal2Q91WC7 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Nipal2Q91WC7 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nipal2Q91WC7 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nipal2Q91WC7 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Nipal2Q91WC7 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Nipal2Q91WC7 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Nipal2Q91WC7 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Nipal2Q91WC7 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nipal2Q91WC7 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nipal2Q91WC7 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nipal2Q91WC7 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nipal2Q91WC7 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nipal2Q91WC7 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nipal2Q91WC7 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nipal2Q91WC7 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nipal2Q91WC7 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nipal2Q91WC7 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nipal2Q91WC7 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nipal2Q91WC7 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nipal2Q91WC7 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nipal2Q91WC7 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nipal2Q91WC7 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Nipal2Q91WC7 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nipal2Q91WC7 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Nipal2Q91WC7 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Nipal2Q91WC7 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nipal2Q91WC7 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nipal2Q91WC7 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nipal2Q91WC7 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nipal2Q91WC7 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nipal2Q91WC7 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nipal2Q91WC7 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms