Protein–RNA interactions for Protein: Q91UZ8

Pcdhb11, MCG141285, mousemouse

Predictions only

Length 797 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcdhb11Q91UZ8 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pcdhb11Q91UZ8 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pcdhb11Q91UZ8 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pcdhb11Q91UZ8 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pcdhb11Q91UZ8 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pcdhb11Q91UZ8 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pcdhb11Q91UZ8 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pcdhb11Q91UZ8 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pcdhb11Q91UZ8 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pcdhb11Q91UZ8 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pcdhb11Q91UZ8 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pcdhb11Q91UZ8 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pcdhb11Q91UZ8 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pcdhb11Q91UZ8 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pcdhb11Q91UZ8 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pcdhb11Q91UZ8 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Pcdhb11Q91UZ8 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pcdhb11Q91UZ8 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pcdhb11Q91UZ8 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pcdhb11Q91UZ8 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pcdhb11Q91UZ8 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pcdhb11Q91UZ8 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Pcdhb11Q91UZ8 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Pcdhb11Q91UZ8 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Pcdhb11Q91UZ8 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Pcdhb11Q91UZ8 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Pcdhb11Q91UZ8 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Pcdhb11Q91UZ8 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Pcdhb11Q91UZ8 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Pcdhb11Q91UZ8 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pcdhb11Q91UZ8 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pcdhb11Q91UZ8 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pcdhb11Q91UZ8 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pcdhb11Q91UZ8 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pcdhb11Q91UZ8 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pcdhb11Q91UZ8 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pcdhb11Q91UZ8 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pcdhb11Q91UZ8 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pcdhb11Q91UZ8 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pcdhb11Q91UZ8 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pcdhb11Q91UZ8 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pcdhb11Q91UZ8 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pcdhb11Q91UZ8 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pcdhb11Q91UZ8 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pcdhb11Q91UZ8 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pcdhb11Q91UZ8 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Pcdhb11Q91UZ8 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pcdhb11Q91UZ8 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pcdhb11Q91UZ8 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Pcdhb11Q91UZ8 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Pcdhb11Q91UZ8 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Pcdhb11Q91UZ8 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Pcdhb11Q91UZ8 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Pcdhb11Q91UZ8 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Pcdhb11Q91UZ8 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pcdhb11Q91UZ8 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Pcdhb11Q91UZ8 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pcdhb11Q91UZ8 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pcdhb11Q91UZ8 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pcdhb11Q91UZ8 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pcdhb11Q91UZ8 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pcdhb11Q91UZ8 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pcdhb11Q91UZ8 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pcdhb11Q91UZ8 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pcdhb11Q91UZ8 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pcdhb11Q91UZ8 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pcdhb11Q91UZ8 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pcdhb11Q91UZ8 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pcdhb11Q91UZ8 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pcdhb11Q91UZ8 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pcdhb11Q91UZ8 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pcdhb11Q91UZ8 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pcdhb11Q91UZ8 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pcdhb11Q91UZ8 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pcdhb11Q91UZ8 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pcdhb11Q91UZ8 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pcdhb11Q91UZ8 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pcdhb11Q91UZ8 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pcdhb11Q91UZ8 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pcdhb11Q91UZ8 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pcdhb11Q91UZ8 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pcdhb11Q91UZ8 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pcdhb11Q91UZ8 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Pcdhb11Q91UZ8 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Pcdhb11Q91UZ8 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Pcdhb11Q91UZ8 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Pcdhb11Q91UZ8 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Pcdhb11Q91UZ8 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Pcdhb11Q91UZ8 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pcdhb11Q91UZ8 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pcdhb11Q91UZ8 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pcdhb11Q91UZ8 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pcdhb11Q91UZ8 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pcdhb11Q91UZ8 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Pcdhb11Q91UZ8 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pcdhb11Q91UZ8 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pcdhb11Q91UZ8 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pcdhb11Q91UZ8 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pcdhb11Q91UZ8 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pcdhb11Q91UZ8 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms