Protein–RNA interactions for Protein: Q8VED5

Krt79, Keratin, type II cytoskeletal 79, mousemouse

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Length 531 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt79Q8VED5 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Krt79Q8VED5 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Krt79Q8VED5 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Krt79Q8VED5 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Krt79Q8VED5 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Krt79Q8VED5 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Krt79Q8VED5 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Krt79Q8VED5 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Krt79Q8VED5 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Krt79Q8VED5 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Krt79Q8VED5 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Krt79Q8VED5 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Krt79Q8VED5 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Krt79Q8VED5 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Krt79Q8VED5 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Krt79Q8VED5 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Krt79Q8VED5 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Krt79Q8VED5 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Krt79Q8VED5 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Krt79Q8VED5 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Krt79Q8VED5 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Krt79Q8VED5 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Krt79Q8VED5 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Krt79Q8VED5 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Krt79Q8VED5 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Krt79Q8VED5 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Krt79Q8VED5 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Krt79Q8VED5 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Krt79Q8VED5 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Krt79Q8VED5 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Krt79Q8VED5 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Krt79Q8VED5 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Krt79Q8VED5 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Krt79Q8VED5 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Krt79Q8VED5 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Krt79Q8VED5 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Krt79Q8VED5 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Krt79Q8VED5 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Krt79Q8VED5 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Krt79Q8VED5 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Krt79Q8VED5 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Krt79Q8VED5 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Krt79Q8VED5 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Krt79Q8VED5 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Krt79Q8VED5 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Krt79Q8VED5 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Krt79Q8VED5 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Krt79Q8VED5 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Krt79Q8VED5 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Krt79Q8VED5 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Krt79Q8VED5 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Krt79Q8VED5 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Krt79Q8VED5 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Krt79Q8VED5 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Krt79Q8VED5 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Krt79Q8VED5 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Krt79Q8VED5 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Krt79Q8VED5 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Krt79Q8VED5 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Krt79Q8VED5 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Krt79Q8VED5 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Krt79Q8VED5 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Krt79Q8VED5 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Krt79Q8VED5 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Krt79Q8VED5 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
Krt79Q8VED5 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Krt79Q8VED5 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Krt79Q8VED5 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Krt79Q8VED5 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Krt79Q8VED5 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Krt79Q8VED5 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Krt79Q8VED5 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Krt79Q8VED5 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Krt79Q8VED5 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Krt79Q8VED5 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Krt79Q8VED5 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Krt79Q8VED5 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Krt79Q8VED5 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Krt79Q8VED5 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Krt79Q8VED5 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Krt79Q8VED5 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Krt79Q8VED5 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Krt79Q8VED5 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Krt79Q8VED5 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Krt79Q8VED5 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Krt79Q8VED5 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Krt79Q8VED5 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Krt79Q8VED5 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Krt79Q8VED5 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Krt79Q8VED5 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Krt79Q8VED5 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Krt79Q8VED5 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Krt79Q8VED5 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Krt79Q8VED5 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Krt79Q8VED5 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Krt79Q8VED5 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Krt79Q8VED5 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Krt79Q8VED5 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Krt79Q8VED5 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Krt79Q8VED5 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 169.2 ms