Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE18

Smg8, Protein SMG8, mousemouse

Predictions only

Length 991 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg8Q8VE18 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Smg8Q8VE18 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Smg8Q8VE18 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Smg8Q8VE18 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Smg8Q8VE18 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Smg8Q8VE18 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Smg8Q8VE18 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Smg8Q8VE18 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Smg8Q8VE18 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Smg8Q8VE18 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Smg8Q8VE18 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Smg8Q8VE18 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Smg8Q8VE18 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Smg8Q8VE18 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Smg8Q8VE18 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Smg8Q8VE18 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Smg8Q8VE18 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Smg8Q8VE18 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Smg8Q8VE18 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Smg8Q8VE18 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Smg8Q8VE18 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Smg8Q8VE18 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Smg8Q8VE18 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Smg8Q8VE18 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Smg8Q8VE18 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Smg8Q8VE18 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Smg8Q8VE18 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Smg8Q8VE18 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Smg8Q8VE18 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Smg8Q8VE18 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Smg8Q8VE18 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Smg8Q8VE18 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Smg8Q8VE18 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Smg8Q8VE18 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Smg8Q8VE18 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Smg8Q8VE18 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Smg8Q8VE18 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Smg8Q8VE18 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Smg8Q8VE18 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Smg8Q8VE18 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Smg8Q8VE18 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Smg8Q8VE18 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Smg8Q8VE18 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Smg8Q8VE18 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Smg8Q8VE18 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Smg8Q8VE18 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Smg8Q8VE18 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Smg8Q8VE18 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Smg8Q8VE18 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Smg8Q8VE18 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Smg8Q8VE18 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Smg8Q8VE18 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Smg8Q8VE18 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Smg8Q8VE18 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Smg8Q8VE18 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Smg8Q8VE18 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Smg8Q8VE18 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Smg8Q8VE18 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Smg8Q8VE18 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Smg8Q8VE18 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Smg8Q8VE18 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Smg8Q8VE18 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Smg8Q8VE18 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Smg8Q8VE18 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Smg8Q8VE18 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Smg8Q8VE18 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Smg8Q8VE18 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Smg8Q8VE18 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Smg8Q8VE18 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Smg8Q8VE18 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Smg8Q8VE18 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Smg8Q8VE18 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Smg8Q8VE18 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Smg8Q8VE18 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Smg8Q8VE18 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Smg8Q8VE18 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Smg8Q8VE18 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Smg8Q8VE18 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Smg8Q8VE18 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Smg8Q8VE18 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Smg8Q8VE18 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Smg8Q8VE18 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Smg8Q8VE18 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Smg8Q8VE18 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Smg8Q8VE18 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Smg8Q8VE18 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Smg8Q8VE18 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Smg8Q8VE18 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Smg8Q8VE18 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Smg8Q8VE18 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Smg8Q8VE18 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Smg8Q8VE18 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Smg8Q8VE18 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Smg8Q8VE18 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Smg8Q8VE18 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Smg8Q8VE18 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Smg8Q8VE18 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Smg8Q8VE18 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Smg8Q8VE18 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Smg8Q8VE18 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms