Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDM4

Psmd2, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 2, mousemouse

Predictions only

Length 908 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmd2Q8VDM4 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Psmd2Q8VDM4 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Psmd2Q8VDM4 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Psmd2Q8VDM4 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Psmd2Q8VDM4 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Psmd2Q8VDM4 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Psmd2Q8VDM4 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Psmd2Q8VDM4 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Psmd2Q8VDM4 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Psmd2Q8VDM4 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Psmd2Q8VDM4 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Psmd2Q8VDM4 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Psmd2Q8VDM4 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Psmd2Q8VDM4 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Psmd2Q8VDM4 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Psmd2Q8VDM4 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Psmd2Q8VDM4 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Psmd2Q8VDM4 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Psmd2Q8VDM4 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Psmd2Q8VDM4 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Psmd2Q8VDM4 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Psmd2Q8VDM4 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Psmd2Q8VDM4 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Psmd2Q8VDM4 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Psmd2Q8VDM4 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Psmd2Q8VDM4 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Psmd2Q8VDM4 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Psmd2Q8VDM4 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Psmd2Q8VDM4 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Psmd2Q8VDM4 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Psmd2Q8VDM4 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Psmd2Q8VDM4 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Psmd2Q8VDM4 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Psmd2Q8VDM4 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Psmd2Q8VDM4 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Psmd2Q8VDM4 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Psmd2Q8VDM4 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Psmd2Q8VDM4 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Psmd2Q8VDM4 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Psmd2Q8VDM4 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Psmd2Q8VDM4 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Psmd2Q8VDM4 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Psmd2Q8VDM4 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Psmd2Q8VDM4 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Psmd2Q8VDM4 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Psmd2Q8VDM4 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Psmd2Q8VDM4 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Psmd2Q8VDM4 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Psmd2Q8VDM4 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Psmd2Q8VDM4 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Psmd2Q8VDM4 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Psmd2Q8VDM4 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Psmd2Q8VDM4 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Psmd2Q8VDM4 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Psmd2Q8VDM4 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Psmd2Q8VDM4 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Psmd2Q8VDM4 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Psmd2Q8VDM4 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Psmd2Q8VDM4 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Psmd2Q8VDM4 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Psmd2Q8VDM4 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Psmd2Q8VDM4 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Psmd2Q8VDM4 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Psmd2Q8VDM4 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Psmd2Q8VDM4 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Psmd2Q8VDM4 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Psmd2Q8VDM4 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Psmd2Q8VDM4 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Psmd2Q8VDM4 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Psmd2Q8VDM4 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Psmd2Q8VDM4 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Psmd2Q8VDM4 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Psmd2Q8VDM4 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Psmd2Q8VDM4 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Psmd2Q8VDM4 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Psmd2Q8VDM4 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Psmd2Q8VDM4 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Psmd2Q8VDM4 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Psmd2Q8VDM4 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Psmd2Q8VDM4 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Psmd2Q8VDM4 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Psmd2Q8VDM4 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Psmd2Q8VDM4 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Psmd2Q8VDM4 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Psmd2Q8VDM4 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Psmd2Q8VDM4 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Psmd2Q8VDM4 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Psmd2Q8VDM4 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Psmd2Q8VDM4 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Psmd2Q8VDM4 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Psmd2Q8VDM4 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Psmd2Q8VDM4 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Psmd2Q8VDM4 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Psmd2Q8VDM4 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Psmd2Q8VDM4 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Psmd2Q8VDM4 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Psmd2Q8VDM4 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Psmd2Q8VDM4 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Psmd2Q8VDM4 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Psmd2Q8VDM4 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms