Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDB9

Slc6a20a, Sodium- and chloride-dependent transporter XTRP3A, mousemouse

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Length 592 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc6a20aQ8VDB9 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Slc6a20aQ8VDB9 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Slc6a20aQ8VDB9 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Slc6a20aQ8VDB9 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Slc6a20aQ8VDB9 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Slc6a20aQ8VDB9 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Slc6a20aQ8VDB9 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Slc6a20aQ8VDB9 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Slc6a20aQ8VDB9 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Slc6a20aQ8VDB9 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Slc6a20aQ8VDB9 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Slc6a20aQ8VDB9 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Slc6a20aQ8VDB9 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Slc6a20aQ8VDB9 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Slc6a20aQ8VDB9 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Slc6a20aQ8VDB9 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Slc6a20aQ8VDB9 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Slc6a20aQ8VDB9 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Slc6a20aQ8VDB9 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Slc6a20aQ8VDB9 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Slc6a20aQ8VDB9 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Slc6a20aQ8VDB9 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Slc6a20aQ8VDB9 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Slc6a20aQ8VDB9 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Slc6a20aQ8VDB9 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Slc6a20aQ8VDB9 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Slc6a20aQ8VDB9 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Slc6a20aQ8VDB9 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Slc6a20aQ8VDB9 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Slc6a20aQ8VDB9 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Slc6a20aQ8VDB9 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Slc6a20aQ8VDB9 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Slc6a20aQ8VDB9 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Slc6a20aQ8VDB9 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Slc6a20aQ8VDB9 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Slc6a20aQ8VDB9 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Slc6a20aQ8VDB9 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Slc6a20aQ8VDB9 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Slc6a20aQ8VDB9 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Slc6a20aQ8VDB9 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Slc6a20aQ8VDB9 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Slc6a20aQ8VDB9 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Slc6a20aQ8VDB9 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Slc6a20aQ8VDB9 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Slc6a20aQ8VDB9 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Slc6a20aQ8VDB9 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
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Slc6a20aQ8VDB9 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Slc6a20aQ8VDB9 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Slc6a20aQ8VDB9 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Slc6a20aQ8VDB9 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Slc6a20aQ8VDB9 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Slc6a20aQ8VDB9 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Slc6a20aQ8VDB9 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Slc6a20aQ8VDB9 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Slc6a20aQ8VDB9 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Slc6a20aQ8VDB9 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Slc6a20aQ8VDB9 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Slc6a20aQ8VDB9 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Slc6a20aQ8VDB9 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Slc6a20aQ8VDB9 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Slc6a20aQ8VDB9 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Slc6a20aQ8VDB9 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Slc6a20aQ8VDB9 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Slc6a20aQ8VDB9 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Slc6a20aQ8VDB9 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Slc6a20aQ8VDB9 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Slc6a20aQ8VDB9 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Slc6a20aQ8VDB9 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Slc6a20aQ8VDB9 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Slc6a20aQ8VDB9 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Slc6a20aQ8VDB9 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Slc6a20aQ8VDB9 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Slc6a20aQ8VDB9 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Slc6a20aQ8VDB9 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Slc6a20aQ8VDB9 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Slc6a20aQ8VDB9 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Slc6a20aQ8VDB9 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Slc6a20aQ8VDB9 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Slc6a20aQ8VDB9 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Slc6a20aQ8VDB9 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Slc6a20aQ8VDB9 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Slc6a20aQ8VDB9 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Slc6a20aQ8VDB9 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Slc6a20aQ8VDB9 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Slc6a20aQ8VDB9 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Slc6a20aQ8VDB9 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Slc6a20aQ8VDB9 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Slc6a20aQ8VDB9 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Slc6a20aQ8VDB9 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Slc6a20aQ8VDB9 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Slc6a20aQ8VDB9 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Slc6a20aQ8VDB9 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Slc6a20aQ8VDB9 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Slc6a20aQ8VDB9 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Slc6a20aQ8VDB9 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Slc6a20aQ8VDB9 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Slc6a20aQ8VDB9 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Slc6a20aQ8VDB9 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Slc6a20aQ8VDB9 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
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