Protein–RNA interactions for Protein: Q8VC34

Rpap2, Putative RNA polymerase II subunit B1 CTD phosphatase Rpap2, mousemouse

Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpap2Q8VC34 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Rpap2Q8VC34 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Rpap2Q8VC34 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Rpap2Q8VC34 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Rpap2Q8VC34 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Rpap2Q8VC34 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Rpap2Q8VC34 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Rpap2Q8VC34 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Rpap2Q8VC34 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Rpap2Q8VC34 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Rpap2Q8VC34 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Rpap2Q8VC34 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Rpap2Q8VC34 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Rpap2Q8VC34 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Rpap2Q8VC34 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Rpap2Q8VC34 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Rpap2Q8VC34 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Rpap2Q8VC34 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Rpap2Q8VC34 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Rpap2Q8VC34 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Rpap2Q8VC34 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Rpap2Q8VC34 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Rpap2Q8VC34 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Rpap2Q8VC34 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Rpap2Q8VC34 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Rpap2Q8VC34 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Rpap2Q8VC34 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Rpap2Q8VC34 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Rpap2Q8VC34 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Rpap2Q8VC34 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Rpap2Q8VC34 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Rpap2Q8VC34 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Rpap2Q8VC34 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Rpap2Q8VC34 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Rpap2Q8VC34 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Rpap2Q8VC34 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Rpap2Q8VC34 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Rpap2Q8VC34 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Rpap2Q8VC34 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Rpap2Q8VC34 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Rpap2Q8VC34 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Rpap2Q8VC34 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Rpap2Q8VC34 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Rpap2Q8VC34 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Rpap2Q8VC34 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Rpap2Q8VC34 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Rpap2Q8VC34 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Rpap2Q8VC34 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Rpap2Q8VC34 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Rpap2Q8VC34 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Rpap2Q8VC34 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Rpap2Q8VC34 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Rpap2Q8VC34 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Rpap2Q8VC34 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rpap2Q8VC34 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rpap2Q8VC34 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rpap2Q8VC34 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rpap2Q8VC34 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rpap2Q8VC34 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rpap2Q8VC34 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Rpap2Q8VC34 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Rpap2Q8VC34 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Rpap2Q8VC34 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Rpap2Q8VC34 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Rpap2Q8VC34 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Rpap2Q8VC34 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Rpap2Q8VC34 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Rpap2Q8VC34 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Rpap2Q8VC34 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Rpap2Q8VC34 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Rpap2Q8VC34 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Rpap2Q8VC34 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Rpap2Q8VC34 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Rpap2Q8VC34 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Rpap2Q8VC34 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Rpap2Q8VC34 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Rpap2Q8VC34 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Rpap2Q8VC34 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Rpap2Q8VC34 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Rpap2Q8VC34 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Rpap2Q8VC34 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Rpap2Q8VC34 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Rpap2Q8VC34 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Rpap2Q8VC34 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Rpap2Q8VC34 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Rpap2Q8VC34 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Rpap2Q8VC34 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Rpap2Q8VC34 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Rpap2Q8VC34 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Rpap2Q8VC34 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Rpap2Q8VC34 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Rpap2Q8VC34 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Rpap2Q8VC34 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Rpap2Q8VC34 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Rpap2Q8VC34 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Rpap2Q8VC34 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Rpap2Q8VC34 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rpap2Q8VC34 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Rpap2Q8VC34 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Rpap2Q8VC34 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms