Protein–RNA interactions for Protein: Q8R332

Nup58, Nucleoporin p58/p45, mousemouse

Predictions only

Length 587 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup58Q8R332 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Nup58Q8R332 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Nup58Q8R332 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Nup58Q8R332 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Nup58Q8R332 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Nup58Q8R332 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Nup58Q8R332 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Nup58Q8R332 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Nup58Q8R332 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Nup58Q8R332 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Nup58Q8R332 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Nup58Q8R332 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Nup58Q8R332 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Nup58Q8R332 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Nup58Q8R332 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Nup58Q8R332 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Nup58Q8R332 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Nup58Q8R332 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Nup58Q8R332 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Nup58Q8R332 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Nup58Q8R332 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Nup58Q8R332 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Nup58Q8R332 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Nup58Q8R332 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Nup58Q8R332 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Nup58Q8R332 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Nup58Q8R332 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Nup58Q8R332 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Nup58Q8R332 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Nup58Q8R332 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Nup58Q8R332 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Nup58Q8R332 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Nup58Q8R332 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Nup58Q8R332 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Nup58Q8R332 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Nup58Q8R332 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Nup58Q8R332 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Nup58Q8R332 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Nup58Q8R332 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Nup58Q8R332 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Nup58Q8R332 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Nup58Q8R332 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Nup58Q8R332 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Nup58Q8R332 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Nup58Q8R332 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Nup58Q8R332 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Nup58Q8R332 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Nup58Q8R332 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Nup58Q8R332 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Nup58Q8R332 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Nup58Q8R332 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Nup58Q8R332 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Nup58Q8R332 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Nup58Q8R332 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Nup58Q8R332 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Nup58Q8R332 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Nup58Q8R332 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Nup58Q8R332 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Nup58Q8R332 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Nup58Q8R332 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Nup58Q8R332 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Nup58Q8R332 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Nup58Q8R332 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Nup58Q8R332 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Nup58Q8R332 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Nup58Q8R332 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Nup58Q8R332 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Nup58Q8R332 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Nup58Q8R332 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Nup58Q8R332 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Nup58Q8R332 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Nup58Q8R332 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Nup58Q8R332 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Nup58Q8R332 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Nup58Q8R332 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Nup58Q8R332 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Nup58Q8R332 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Nup58Q8R332 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Nup58Q8R332 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Nup58Q8R332 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Nup58Q8R332 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Nup58Q8R332 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Nup58Q8R332 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Nup58Q8R332 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Nup58Q8R332 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Nup58Q8R332 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Nup58Q8R332 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Nup58Q8R332 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Nup58Q8R332 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Nup58Q8R332 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Nup58Q8R332 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Nup58Q8R332 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Nup58Q8R332 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Nup58Q8R332 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Nup58Q8R332 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Nup58Q8R332 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Nup58Q8R332 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Nup58Q8R332 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Nup58Q8R332 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Nup58Q8R332 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms