Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2T8

Paf1, RNA polymerase II-associated factor 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Paf1Q8K2T8 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Paf1Q8K2T8 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Paf1Q8K2T8 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Paf1Q8K2T8 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Paf1Q8K2T8 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Paf1Q8K2T8 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
Paf1Q8K2T8 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Paf1Q8K2T8 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Paf1Q8K2T8 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Paf1Q8K2T8 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Paf1Q8K2T8 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Paf1Q8K2T8 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
Paf1Q8K2T8 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Paf1Q8K2T8 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Paf1Q8K2T8 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Paf1Q8K2T8 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Paf1Q8K2T8 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Paf1Q8K2T8 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Paf1Q8K2T8 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Paf1Q8K2T8 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Paf1Q8K2T8 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Paf1Q8K2T8 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Paf1Q8K2T8 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Paf1Q8K2T8 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
Paf1Q8K2T8 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Paf1Q8K2T8 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Paf1Q8K2T8 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
Paf1Q8K2T8 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Paf1Q8K2T8 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Paf1Q8K2T8 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Paf1Q8K2T8 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Paf1Q8K2T8 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Paf1Q8K2T8 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Paf1Q8K2T8 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Paf1Q8K2T8 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Paf1Q8K2T8 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Paf1Q8K2T8 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Paf1Q8K2T8 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Paf1Q8K2T8 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Paf1Q8K2T8 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Paf1Q8K2T8 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Paf1Q8K2T8 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Paf1Q8K2T8 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Paf1Q8K2T8 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Paf1Q8K2T8 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Paf1Q8K2T8 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Paf1Q8K2T8 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Paf1Q8K2T8 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Paf1Q8K2T8 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Paf1Q8K2T8 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Paf1Q8K2T8 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Paf1Q8K2T8 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Paf1Q8K2T8 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Paf1Q8K2T8 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Paf1Q8K2T8 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Paf1Q8K2T8 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Paf1Q8K2T8 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Paf1Q8K2T8 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Paf1Q8K2T8 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Paf1Q8K2T8 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC26.2■■□□□ 1.79
Paf1Q8K2T8 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Paf1Q8K2T8 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Paf1Q8K2T8 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Paf1Q8K2T8 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Paf1Q8K2T8 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
Paf1Q8K2T8 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Paf1Q8K2T8 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Paf1Q8K2T8 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Paf1Q8K2T8 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Paf1Q8K2T8 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Paf1Q8K2T8 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Paf1Q8K2T8 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Paf1Q8K2T8 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Paf1Q8K2T8 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Paf1Q8K2T8 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Paf1Q8K2T8 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Paf1Q8K2T8 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Paf1Q8K2T8 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
Paf1Q8K2T8 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Paf1Q8K2T8 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Paf1Q8K2T8 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
Paf1Q8K2T8 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
Paf1Q8K2T8 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Paf1Q8K2T8 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Paf1Q8K2T8 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Paf1Q8K2T8 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Paf1Q8K2T8 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Paf1Q8K2T8 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Paf1Q8K2T8 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Paf1Q8K2T8 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Paf1Q8K2T8 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Paf1Q8K2T8 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Paf1Q8K2T8 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Paf1Q8K2T8 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Paf1Q8K2T8 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Paf1Q8K2T8 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Paf1Q8K2T8 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Paf1Q8K2T8 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Paf1Q8K2T8 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Paf1Q8K2T8 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms