Protein–RNA interactions for Protein: Q8K299

Scara5, Scavenger receptor class A member 5, mousemouse

Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scara5Q8K299 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Scara5Q8K299 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Scara5Q8K299 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Scara5Q8K299 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Scara5Q8K299 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Scara5Q8K299 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Scara5Q8K299 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Scara5Q8K299 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Scara5Q8K299 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Scara5Q8K299 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Scara5Q8K299 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Scara5Q8K299 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Scara5Q8K299 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Scara5Q8K299 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Scara5Q8K299 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Scara5Q8K299 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Scara5Q8K299 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Scara5Q8K299 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Scara5Q8K299 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Scara5Q8K299 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Scara5Q8K299 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Scara5Q8K299 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Scara5Q8K299 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Scara5Q8K299 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Scara5Q8K299 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Scara5Q8K299 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Scara5Q8K299 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Scara5Q8K299 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Scara5Q8K299 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Scara5Q8K299 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Scara5Q8K299 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Scara5Q8K299 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Scara5Q8K299 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Scara5Q8K299 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Scara5Q8K299 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Scara5Q8K299 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Scara5Q8K299 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Scara5Q8K299 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Scara5Q8K299 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Scara5Q8K299 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Scara5Q8K299 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Scara5Q8K299 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Scara5Q8K299 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Scara5Q8K299 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Scara5Q8K299 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Scara5Q8K299 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Scara5Q8K299 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Scara5Q8K299 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Scara5Q8K299 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Scara5Q8K299 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Scara5Q8K299 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Scara5Q8K299 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Scara5Q8K299 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Scara5Q8K299 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Scara5Q8K299 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Scara5Q8K299 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Scara5Q8K299 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Scara5Q8K299 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Scara5Q8K299 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Scara5Q8K299 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Scara5Q8K299 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Scara5Q8K299 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Scara5Q8K299 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Scara5Q8K299 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Scara5Q8K299 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Scara5Q8K299 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Scara5Q8K299 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Scara5Q8K299 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Scara5Q8K299 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Scara5Q8K299 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Scara5Q8K299 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Scara5Q8K299 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Scara5Q8K299 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Scara5Q8K299 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Scara5Q8K299 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Scara5Q8K299 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Scara5Q8K299 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Scara5Q8K299 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Scara5Q8K299 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Scara5Q8K299 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Scara5Q8K299 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Scara5Q8K299 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Scara5Q8K299 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Scara5Q8K299 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Scara5Q8K299 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Scara5Q8K299 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Scara5Q8K299 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Scara5Q8K299 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Scara5Q8K299 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Scara5Q8K299 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Scara5Q8K299 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Scara5Q8K299 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Scara5Q8K299 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Scara5Q8K299 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Scara5Q8K299 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Scara5Q8K299 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Scara5Q8K299 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Scara5Q8K299 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Scara5Q8K299 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Scara5Q8K299 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.7 ms