Protein–RNA interactions for Protein: Q8JZQ2

Afg3l2, AFG3-like protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 802 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Afg3l2Q8JZQ2 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
Afg3l2Q8JZQ2 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Afg3l2Q8JZQ2 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Afg3l2Q8JZQ2 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Afg3l2Q8JZQ2 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Afg3l2Q8JZQ2 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Afg3l2Q8JZQ2 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Afg3l2Q8JZQ2 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Afg3l2Q8JZQ2 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Afg3l2Q8JZQ2 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Afg3l2Q8JZQ2 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Afg3l2Q8JZQ2 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
Afg3l2Q8JZQ2 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.26
Afg3l2Q8JZQ2 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Afg3l2Q8JZQ2 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Afg3l2Q8JZQ2 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
Afg3l2Q8JZQ2 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Afg3l2Q8JZQ2 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Afg3l2Q8JZQ2 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Afg3l2Q8JZQ2 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
Afg3l2Q8JZQ2 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Afg3l2Q8JZQ2 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Afg3l2Q8JZQ2 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Afg3l2Q8JZQ2 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Afg3l2Q8JZQ2 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Afg3l2Q8JZQ2 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Afg3l2Q8JZQ2 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Afg3l2Q8JZQ2 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Afg3l2Q8JZQ2 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Afg3l2Q8JZQ2 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Afg3l2Q8JZQ2 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Afg3l2Q8JZQ2 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Afg3l2Q8JZQ2 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Afg3l2Q8JZQ2 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Afg3l2Q8JZQ2 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Afg3l2Q8JZQ2 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Afg3l2Q8JZQ2 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Afg3l2Q8JZQ2 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
Afg3l2Q8JZQ2 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Afg3l2Q8JZQ2 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Afg3l2Q8JZQ2 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Afg3l2Q8JZQ2 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Afg3l2Q8JZQ2 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Afg3l2Q8JZQ2 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Afg3l2Q8JZQ2 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Afg3l2Q8JZQ2 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Afg3l2Q8JZQ2 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Afg3l2Q8JZQ2 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Afg3l2Q8JZQ2 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Afg3l2Q8JZQ2 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
Afg3l2Q8JZQ2 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
Afg3l2Q8JZQ2 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
Afg3l2Q8JZQ2 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Afg3l2Q8JZQ2 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
Afg3l2Q8JZQ2 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Afg3l2Q8JZQ2 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Afg3l2Q8JZQ2 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Afg3l2Q8JZQ2 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Afg3l2Q8JZQ2 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Afg3l2Q8JZQ2 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Afg3l2Q8JZQ2 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Afg3l2Q8JZQ2 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Afg3l2Q8JZQ2 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Afg3l2Q8JZQ2 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Afg3l2Q8JZQ2 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
Afg3l2Q8JZQ2 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Afg3l2Q8JZQ2 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Afg3l2Q8JZQ2 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Afg3l2Q8JZQ2 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
Afg3l2Q8JZQ2 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Afg3l2Q8JZQ2 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Afg3l2Q8JZQ2 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Afg3l2Q8JZQ2 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Afg3l2Q8JZQ2 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Afg3l2Q8JZQ2 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Afg3l2Q8JZQ2 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Afg3l2Q8JZQ2 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Afg3l2Q8JZQ2 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Afg3l2Q8JZQ2 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Afg3l2Q8JZQ2 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Afg3l2Q8JZQ2 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Afg3l2Q8JZQ2 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Afg3l2Q8JZQ2 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Afg3l2Q8JZQ2 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Afg3l2Q8JZQ2 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Afg3l2Q8JZQ2 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Afg3l2Q8JZQ2 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Afg3l2Q8JZQ2 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Afg3l2Q8JZQ2 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Afg3l2Q8JZQ2 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Afg3l2Q8JZQ2 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Afg3l2Q8JZQ2 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Afg3l2Q8JZQ2 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Afg3l2Q8JZQ2 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Afg3l2Q8JZQ2 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Afg3l2Q8JZQ2 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Afg3l2Q8JZQ2 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Afg3l2Q8JZQ2 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Afg3l2Q8JZQ2 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Afg3l2Q8JZQ2 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms