Protein–RNA interactions for Protein: Q8JZP2

Syn3, Synapsin-3, mousemouse

Predictions only

Length 579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syn3Q8JZP2 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Syn3Q8JZP2 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Syn3Q8JZP2 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Syn3Q8JZP2 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Syn3Q8JZP2 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Syn3Q8JZP2 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Syn3Q8JZP2 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Syn3Q8JZP2 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Syn3Q8JZP2 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Syn3Q8JZP2 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Syn3Q8JZP2 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Syn3Q8JZP2 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Syn3Q8JZP2 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Syn3Q8JZP2 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Syn3Q8JZP2 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Syn3Q8JZP2 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Syn3Q8JZP2 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Syn3Q8JZP2 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Syn3Q8JZP2 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Syn3Q8JZP2 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Syn3Q8JZP2 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Syn3Q8JZP2 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Syn3Q8JZP2 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Syn3Q8JZP2 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Syn3Q8JZP2 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Syn3Q8JZP2 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Syn3Q8JZP2 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Syn3Q8JZP2 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Syn3Q8JZP2 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Syn3Q8JZP2 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Syn3Q8JZP2 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Syn3Q8JZP2 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Syn3Q8JZP2 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Syn3Q8JZP2 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Syn3Q8JZP2 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Syn3Q8JZP2 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Syn3Q8JZP2 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Syn3Q8JZP2 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Syn3Q8JZP2 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Syn3Q8JZP2 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Syn3Q8JZP2 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Syn3Q8JZP2 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Syn3Q8JZP2 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Syn3Q8JZP2 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Syn3Q8JZP2 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Syn3Q8JZP2 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Syn3Q8JZP2 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Syn3Q8JZP2 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Syn3Q8JZP2 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Syn3Q8JZP2 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Syn3Q8JZP2 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Syn3Q8JZP2 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Syn3Q8JZP2 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Syn3Q8JZP2 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Syn3Q8JZP2 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Syn3Q8JZP2 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Syn3Q8JZP2 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Syn3Q8JZP2 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Syn3Q8JZP2 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Syn3Q8JZP2 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Syn3Q8JZP2 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Syn3Q8JZP2 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Syn3Q8JZP2 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Syn3Q8JZP2 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Syn3Q8JZP2 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Syn3Q8JZP2 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Syn3Q8JZP2 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Syn3Q8JZP2 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Syn3Q8JZP2 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Syn3Q8JZP2 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Syn3Q8JZP2 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Syn3Q8JZP2 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Syn3Q8JZP2 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Syn3Q8JZP2 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Syn3Q8JZP2 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Syn3Q8JZP2 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Syn3Q8JZP2 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Syn3Q8JZP2 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Syn3Q8JZP2 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Syn3Q8JZP2 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Syn3Q8JZP2 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Syn3Q8JZP2 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Syn3Q8JZP2 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Syn3Q8JZP2 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Syn3Q8JZP2 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Syn3Q8JZP2 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Syn3Q8JZP2 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Syn3Q8JZP2 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Syn3Q8JZP2 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Syn3Q8JZP2 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Syn3Q8JZP2 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Syn3Q8JZP2 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Syn3Q8JZP2 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Syn3Q8JZP2 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Syn3Q8JZP2 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Syn3Q8JZP2 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Syn3Q8JZP2 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Syn3Q8JZP2 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Syn3Q8JZP2 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Syn3Q8JZP2 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms