Protein–RNA interactions for Protein: Q8CGR7

Upp2, Uridine phosphorylase 2, mousemouse

Predictions only

Length 320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upp2Q8CGR7 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Upp2Q8CGR7 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Upp2Q8CGR7 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Upp2Q8CGR7 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Upp2Q8CGR7 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Upp2Q8CGR7 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Upp2Q8CGR7 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Upp2Q8CGR7 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Upp2Q8CGR7 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Upp2Q8CGR7 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Upp2Q8CGR7 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Upp2Q8CGR7 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Upp2Q8CGR7 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Upp2Q8CGR7 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Upp2Q8CGR7 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Upp2Q8CGR7 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Upp2Q8CGR7 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Upp2Q8CGR7 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Upp2Q8CGR7 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Upp2Q8CGR7 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Upp2Q8CGR7 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Upp2Q8CGR7 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Upp2Q8CGR7 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Upp2Q8CGR7 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Upp2Q8CGR7 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Upp2Q8CGR7 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Upp2Q8CGR7 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Upp2Q8CGR7 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Upp2Q8CGR7 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Upp2Q8CGR7 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Upp2Q8CGR7 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Upp2Q8CGR7 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Upp2Q8CGR7 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Upp2Q8CGR7 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Upp2Q8CGR7 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Upp2Q8CGR7 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Upp2Q8CGR7 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Upp2Q8CGR7 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Upp2Q8CGR7 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Upp2Q8CGR7 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Upp2Q8CGR7 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Upp2Q8CGR7 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Upp2Q8CGR7 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Upp2Q8CGR7 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Upp2Q8CGR7 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Upp2Q8CGR7 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Upp2Q8CGR7 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Upp2Q8CGR7 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Upp2Q8CGR7 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Upp2Q8CGR7 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Upp2Q8CGR7 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Upp2Q8CGR7 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Upp2Q8CGR7 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Upp2Q8CGR7 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Upp2Q8CGR7 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Upp2Q8CGR7 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Upp2Q8CGR7 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Upp2Q8CGR7 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Upp2Q8CGR7 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Upp2Q8CGR7 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Upp2Q8CGR7 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Upp2Q8CGR7 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Upp2Q8CGR7 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Upp2Q8CGR7 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Upp2Q8CGR7 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Upp2Q8CGR7 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Upp2Q8CGR7 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Upp2Q8CGR7 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Upp2Q8CGR7 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Upp2Q8CGR7 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Upp2Q8CGR7 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Upp2Q8CGR7 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Upp2Q8CGR7 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Upp2Q8CGR7 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Upp2Q8CGR7 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Upp2Q8CGR7 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Upp2Q8CGR7 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Upp2Q8CGR7 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Upp2Q8CGR7 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Upp2Q8CGR7 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Upp2Q8CGR7 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Upp2Q8CGR7 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Upp2Q8CGR7 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Upp2Q8CGR7 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Upp2Q8CGR7 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Upp2Q8CGR7 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Upp2Q8CGR7 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Upp2Q8CGR7 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Upp2Q8CGR7 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Upp2Q8CGR7 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Upp2Q8CGR7 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Upp2Q8CGR7 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Upp2Q8CGR7 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Upp2Q8CGR7 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Upp2Q8CGR7 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Upp2Q8CGR7 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Upp2Q8CGR7 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Upp2Q8CGR7 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Upp2Q8CGR7 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Upp2Q8CGR7 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms