Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEG8

Usp27, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 27, mousemouse

Predictions only

Length 438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp27Q8CEG8 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Usp27Q8CEG8 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Usp27Q8CEG8 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Usp27Q8CEG8 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Usp27Q8CEG8 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Usp27Q8CEG8 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Usp27Q8CEG8 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Usp27Q8CEG8 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Usp27Q8CEG8 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Usp27Q8CEG8 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Usp27Q8CEG8 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Usp27Q8CEG8 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Usp27Q8CEG8 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Usp27Q8CEG8 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Usp27Q8CEG8 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Usp27Q8CEG8 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Usp27Q8CEG8 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Usp27Q8CEG8 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Usp27Q8CEG8 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Usp27Q8CEG8 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Usp27Q8CEG8 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Usp27Q8CEG8 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Usp27Q8CEG8 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Usp27Q8CEG8 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Usp27Q8CEG8 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Usp27Q8CEG8 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Usp27Q8CEG8 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Usp27Q8CEG8 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Usp27Q8CEG8 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Usp27Q8CEG8 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Usp27Q8CEG8 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Usp27Q8CEG8 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Usp27Q8CEG8 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Usp27Q8CEG8 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Usp27Q8CEG8 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Usp27Q8CEG8 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Usp27Q8CEG8 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Usp27Q8CEG8 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Usp27Q8CEG8 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Usp27Q8CEG8 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Usp27Q8CEG8 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Usp27Q8CEG8 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Usp27Q8CEG8 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Usp27Q8CEG8 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Usp27Q8CEG8 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Usp27Q8CEG8 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Usp27Q8CEG8 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Usp27Q8CEG8 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Usp27Q8CEG8 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Usp27Q8CEG8 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Usp27Q8CEG8 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Usp27Q8CEG8 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Usp27Q8CEG8 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Usp27Q8CEG8 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Usp27Q8CEG8 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Usp27Q8CEG8 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Usp27Q8CEG8 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Usp27Q8CEG8 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Usp27Q8CEG8 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Usp27Q8CEG8 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Usp27Q8CEG8 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Usp27Q8CEG8 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Usp27Q8CEG8 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Usp27Q8CEG8 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Usp27Q8CEG8 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Usp27Q8CEG8 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Usp27Q8CEG8 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Usp27Q8CEG8 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Usp27Q8CEG8 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Usp27Q8CEG8 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Usp27Q8CEG8 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Usp27Q8CEG8 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Usp27Q8CEG8 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Usp27Q8CEG8 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Usp27Q8CEG8 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Usp27Q8CEG8 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Usp27Q8CEG8 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Usp27Q8CEG8 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Usp27Q8CEG8 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Usp27Q8CEG8 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Usp27Q8CEG8 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Usp27Q8CEG8 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Usp27Q8CEG8 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Usp27Q8CEG8 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Usp27Q8CEG8 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Usp27Q8CEG8 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Usp27Q8CEG8 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Usp27Q8CEG8 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Usp27Q8CEG8 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Usp27Q8CEG8 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Usp27Q8CEG8 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Usp27Q8CEG8 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Usp27Q8CEG8 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Usp27Q8CEG8 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Usp27Q8CEG8 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Usp27Q8CEG8 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Usp27Q8CEG8 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Usp27Q8CEG8 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Usp27Q8CEG8 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Usp27Q8CEG8 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 156.9 ms