Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDN9

Lrrc9, Leucine-rich repeat-containing protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,456 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc9Q8CDN9 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
Lrrc9Q8CDN9 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
Lrrc9Q8CDN9 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
Lrrc9Q8CDN9 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
Lrrc9Q8CDN9 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC35.11■■■■□ 3.21
Lrrc9Q8CDN9 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
Lrrc9Q8CDN9 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC35.1■■■■□ 3.21
Lrrc9Q8CDN9 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
Lrrc9Q8CDN9 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
Lrrc9Q8CDN9 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
Lrrc9Q8CDN9 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC35.09■■■■□ 3.21
Lrrc9Q8CDN9 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
Lrrc9Q8CDN9 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.08■■■■□ 3.21
Lrrc9Q8CDN9 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
Lrrc9Q8CDN9 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
Lrrc9Q8CDN9 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
Lrrc9Q8CDN9 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC35.06■■■■□ 3.2
Lrrc9Q8CDN9 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC35.06■■■■□ 3.2
Lrrc9Q8CDN9 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
Lrrc9Q8CDN9 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
Lrrc9Q8CDN9 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
Lrrc9Q8CDN9 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.04■■■■□ 3.2
Lrrc9Q8CDN9 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
Lrrc9Q8CDN9 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
Lrrc9Q8CDN9 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
Lrrc9Q8CDN9 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC35.03■■■■□ 3.2
Lrrc9Q8CDN9 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
Lrrc9Q8CDN9 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
Lrrc9Q8CDN9 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
Lrrc9Q8CDN9 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC35.02■■■■□ 3.2
Lrrc9Q8CDN9 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
Lrrc9Q8CDN9 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.19
Lrrc9Q8CDN9 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC35.01■■■■□ 3.19
Lrrc9Q8CDN9 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
Lrrc9Q8CDN9 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
Lrrc9Q8CDN9 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
Lrrc9Q8CDN9 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35■■■■□ 3.19
Lrrc9Q8CDN9 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC35■■■■□ 3.19
Lrrc9Q8CDN9 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
Lrrc9Q8CDN9 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
Lrrc9Q8CDN9 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC34.99■■■■□ 3.19
Lrrc9Q8CDN9 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.98■■■■□ 3.19
Lrrc9Q8CDN9 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
Lrrc9Q8CDN9 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
Lrrc9Q8CDN9 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC34.96■■■■□ 3.19
Lrrc9Q8CDN9 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC34.95■■■■□ 3.19
Lrrc9Q8CDN9 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
Lrrc9Q8CDN9 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
Lrrc9Q8CDN9 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC34.95■■■■□ 3.19
Lrrc9Q8CDN9 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC34.94■■■■□ 3.18
Lrrc9Q8CDN9 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC34.93■■■■□ 3.18
Lrrc9Q8CDN9 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC34.93■■■■□ 3.18
Lrrc9Q8CDN9 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC34.93■■■■□ 3.18
Lrrc9Q8CDN9 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
Lrrc9Q8CDN9 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
Lrrc9Q8CDN9 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
Lrrc9Q8CDN9 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC34.92■■■■□ 3.18
Lrrc9Q8CDN9 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
Lrrc9Q8CDN9 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
Lrrc9Q8CDN9 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.91■■■■□ 3.18
Lrrc9Q8CDN9 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC34.91■■■■□ 3.18
Lrrc9Q8CDN9 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
Lrrc9Q8CDN9 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC34.9■■■■□ 3.18
Lrrc9Q8CDN9 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC34.9■■■■□ 3.18
Lrrc9Q8CDN9 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
Lrrc9Q8CDN9 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
Lrrc9Q8CDN9 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC34.89■■■■□ 3.18
Lrrc9Q8CDN9 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
Lrrc9Q8CDN9 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
Lrrc9Q8CDN9 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
Lrrc9Q8CDN9 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
Lrrc9Q8CDN9 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
Lrrc9Q8CDN9 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
Lrrc9Q8CDN9 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
Lrrc9Q8CDN9 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
Lrrc9Q8CDN9 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
Lrrc9Q8CDN9 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
Lrrc9Q8CDN9 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC34.84■■■■□ 3.17
Lrrc9Q8CDN9 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC34.84■■■■□ 3.17
Lrrc9Q8CDN9 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
Lrrc9Q8CDN9 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC34.83■■■■□ 3.17
Lrrc9Q8CDN9 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC34.83■■■■□ 3.17
Lrrc9Q8CDN9 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
Lrrc9Q8CDN9 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
Lrrc9Q8CDN9 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC34.82■■■■□ 3.16
Lrrc9Q8CDN9 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC34.81■■■■□ 3.16
Lrrc9Q8CDN9 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
Lrrc9Q8CDN9 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
Lrrc9Q8CDN9 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC34.8■■■■□ 3.16
Lrrc9Q8CDN9 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC34.8■■■■□ 3.16
Lrrc9Q8CDN9 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.8■■■■□ 3.16
Lrrc9Q8CDN9 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
Lrrc9Q8CDN9 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
Lrrc9Q8CDN9 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC34.79■■■■□ 3.16
Lrrc9Q8CDN9 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
Lrrc9Q8CDN9 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC34.79■■■■□ 3.16
Lrrc9Q8CDN9 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC34.78■■■■□ 3.16
Lrrc9Q8CDN9 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
Lrrc9Q8CDN9 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC34.78■■■■□ 3.16
Lrrc9Q8CDN9 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 146.4 ms