Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCE9

E4f1, Transcription factor E4F1, mousemouse

Predictions only

Length 783 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E4f1Q8CCE9 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
E4f1Q8CCE9 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
E4f1Q8CCE9 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
E4f1Q8CCE9 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
E4f1Q8CCE9 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
E4f1Q8CCE9 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
E4f1Q8CCE9 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
E4f1Q8CCE9 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
E4f1Q8CCE9 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
E4f1Q8CCE9 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
E4f1Q8CCE9 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
E4f1Q8CCE9 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
E4f1Q8CCE9 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
E4f1Q8CCE9 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
E4f1Q8CCE9 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
E4f1Q8CCE9 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
E4f1Q8CCE9 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
E4f1Q8CCE9 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
E4f1Q8CCE9 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
E4f1Q8CCE9 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
E4f1Q8CCE9 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
E4f1Q8CCE9 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
E4f1Q8CCE9 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
E4f1Q8CCE9 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
E4f1Q8CCE9 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
E4f1Q8CCE9 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
E4f1Q8CCE9 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
E4f1Q8CCE9 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
E4f1Q8CCE9 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
E4f1Q8CCE9 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
E4f1Q8CCE9 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
E4f1Q8CCE9 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
E4f1Q8CCE9 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
E4f1Q8CCE9 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
E4f1Q8CCE9 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
E4f1Q8CCE9 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.84
E4f1Q8CCE9 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
E4f1Q8CCE9 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
E4f1Q8CCE9 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
E4f1Q8CCE9 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
E4f1Q8CCE9 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
E4f1Q8CCE9 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
E4f1Q8CCE9 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
E4f1Q8CCE9 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
E4f1Q8CCE9 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
E4f1Q8CCE9 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
E4f1Q8CCE9 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
E4f1Q8CCE9 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
E4f1Q8CCE9 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
E4f1Q8CCE9 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
E4f1Q8CCE9 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
E4f1Q8CCE9 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
E4f1Q8CCE9 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
E4f1Q8CCE9 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
E4f1Q8CCE9 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
E4f1Q8CCE9 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
E4f1Q8CCE9 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
E4f1Q8CCE9 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
E4f1Q8CCE9 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
E4f1Q8CCE9 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
E4f1Q8CCE9 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
E4f1Q8CCE9 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
E4f1Q8CCE9 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
E4f1Q8CCE9 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
E4f1Q8CCE9 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
E4f1Q8CCE9 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
E4f1Q8CCE9 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
E4f1Q8CCE9 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
E4f1Q8CCE9 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
E4f1Q8CCE9 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
E4f1Q8CCE9 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
E4f1Q8CCE9 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
E4f1Q8CCE9 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
E4f1Q8CCE9 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
E4f1Q8CCE9 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
E4f1Q8CCE9 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
E4f1Q8CCE9 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
E4f1Q8CCE9 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
E4f1Q8CCE9 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
E4f1Q8CCE9 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
E4f1Q8CCE9 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
E4f1Q8CCE9 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
E4f1Q8CCE9 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
E4f1Q8CCE9 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
E4f1Q8CCE9 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
E4f1Q8CCE9 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
E4f1Q8CCE9 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
E4f1Q8CCE9 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
E4f1Q8CCE9 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
E4f1Q8CCE9 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
E4f1Q8CCE9 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
E4f1Q8CCE9 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
E4f1Q8CCE9 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
E4f1Q8CCE9 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
E4f1Q8CCE9 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
E4f1Q8CCE9 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
E4f1Q8CCE9 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
E4f1Q8CCE9 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
E4f1Q8CCE9 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
E4f1Q8CCE9 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.7 ms