Protein–RNA interactions for Protein: Q8CC96

Uncharacterized protein C6orf222 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 669 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8CC96 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Q8CC96 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Q8CC96 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Q8CC96 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Q8CC96 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Q8CC96 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Q8CC96 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Q8CC96 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Q8CC96 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Q8CC96 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Q8CC96 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Q8CC96 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Q8CC96 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Q8CC96 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Q8CC96 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Q8CC96 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Q8CC96 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Q8CC96 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Q8CC96 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Q8CC96 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Q8CC96 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Q8CC96 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Q8CC96 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Q8CC96 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Q8CC96 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Q8CC96 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Q8CC96 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Q8CC96 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Q8CC96 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Q8CC96 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Q8CC96 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Q8CC96 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Q8CC96 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Q8CC96 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Q8CC96 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Q8CC96 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Q8CC96 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Q8CC96 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Q8CC96 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Q8CC96 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Q8CC96 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Q8CC96 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Q8CC96 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Q8CC96 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Q8CC96 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Q8CC96 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Q8CC96 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Q8CC96 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Q8CC96 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Q8CC96 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Q8CC96 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Q8CC96 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Q8CC96 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Q8CC96 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Q8CC96 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Q8CC96 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Q8CC96 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Q8CC96 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Q8CC96 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Q8CC96 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Q8CC96 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Q8CC96 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Q8CC96 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Q8CC96 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Q8CC96 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Q8CC96 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Q8CC96 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Q8CC96 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Q8CC96 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Q8CC96 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Q8CC96 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Q8CC96 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Q8CC96 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Q8CC96 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Q8CC96 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Q8CC96 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Q8CC96 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Q8CC96 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Q8CC96 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Q8CC96 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Q8CC96 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Q8CC96 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Q8CC96 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Q8CC96 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Q8CC96 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Q8CC96 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Q8CC96 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Q8CC96 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Q8CC96 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Q8CC96 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Q8CC96 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Q8CC96 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Q8CC96 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Q8CC96 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Q8CC96 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Q8CC96 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Q8CC96 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Q8CC96 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Q8CC96 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Q8CC96 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms