Protein–RNA interactions for Protein: Q8CC21

Ttc19, Tetratricopeptide repeat protein 19, mitochondrial, mousemouse

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Length 365 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc19Q8CC21 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
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Ttc19Q8CC21 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Ttc19Q8CC21 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Ttc19Q8CC21 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Ttc19Q8CC21 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
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Ttc19Q8CC21 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Ttc19Q8CC21 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
Ttc19Q8CC21 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Ttc19Q8CC21 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Ttc19Q8CC21 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Ttc19Q8CC21 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Ttc19Q8CC21 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Ttc19Q8CC21 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Ttc19Q8CC21 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Ttc19Q8CC21 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Ttc19Q8CC21 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Ttc19Q8CC21 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
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Ttc19Q8CC21 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Ttc19Q8CC21 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Ttc19Q8CC21 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC27.7■■■□□ 2.03
Ttc19Q8CC21 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Ttc19Q8CC21 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.03
Ttc19Q8CC21 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.1 ms