Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9M2

Ccdc15, Coiled-coil domain-containing protein 15, mousemouse

Predictions only

Length 810 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc15Q8C9M2 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ccdc15Q8C9M2 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ccdc15Q8C9M2 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ccdc15Q8C9M2 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ccdc15Q8C9M2 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ccdc15Q8C9M2 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ccdc15Q8C9M2 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ccdc15Q8C9M2 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ccdc15Q8C9M2 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ccdc15Q8C9M2 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ccdc15Q8C9M2 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ccdc15Q8C9M2 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ccdc15Q8C9M2 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ccdc15Q8C9M2 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ccdc15Q8C9M2 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ccdc15Q8C9M2 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ccdc15Q8C9M2 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ccdc15Q8C9M2 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ccdc15Q8C9M2 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Ccdc15Q8C9M2 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Ccdc15Q8C9M2 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ccdc15Q8C9M2 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ccdc15Q8C9M2 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ccdc15Q8C9M2 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ccdc15Q8C9M2 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ccdc15Q8C9M2 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ccdc15Q8C9M2 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ccdc15Q8C9M2 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ccdc15Q8C9M2 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ccdc15Q8C9M2 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ccdc15Q8C9M2 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ccdc15Q8C9M2 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ccdc15Q8C9M2 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ccdc15Q8C9M2 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ccdc15Q8C9M2 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ccdc15Q8C9M2 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ccdc15Q8C9M2 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Ccdc15Q8C9M2 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Ccdc15Q8C9M2 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ccdc15Q8C9M2 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ccdc15Q8C9M2 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ccdc15Q8C9M2 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ccdc15Q8C9M2 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ccdc15Q8C9M2 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ccdc15Q8C9M2 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ccdc15Q8C9M2 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ccdc15Q8C9M2 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ccdc15Q8C9M2 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ccdc15Q8C9M2 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ccdc15Q8C9M2 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ccdc15Q8C9M2 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ccdc15Q8C9M2 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ccdc15Q8C9M2 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ccdc15Q8C9M2 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ccdc15Q8C9M2 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ccdc15Q8C9M2 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ccdc15Q8C9M2 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ccdc15Q8C9M2 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ccdc15Q8C9M2 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Ccdc15Q8C9M2 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ccdc15Q8C9M2 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ccdc15Q8C9M2 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ccdc15Q8C9M2 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ccdc15Q8C9M2 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ccdc15Q8C9M2 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ccdc15Q8C9M2 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ccdc15Q8C9M2 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ccdc15Q8C9M2 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ccdc15Q8C9M2 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Ccdc15Q8C9M2 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ccdc15Q8C9M2 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ccdc15Q8C9M2 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ccdc15Q8C9M2 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ccdc15Q8C9M2 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ccdc15Q8C9M2 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ccdc15Q8C9M2 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ccdc15Q8C9M2 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ccdc15Q8C9M2 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ccdc15Q8C9M2 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ccdc15Q8C9M2 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ccdc15Q8C9M2 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ccdc15Q8C9M2 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ccdc15Q8C9M2 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ccdc15Q8C9M2 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ccdc15Q8C9M2 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ccdc15Q8C9M2 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ccdc15Q8C9M2 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Ccdc15Q8C9M2 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ccdc15Q8C9M2 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ccdc15Q8C9M2 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ccdc15Q8C9M2 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ccdc15Q8C9M2 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ccdc15Q8C9M2 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ccdc15Q8C9M2 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ccdc15Q8C9M2 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ccdc15Q8C9M2 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ccdc15Q8C9M2 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ccdc15Q8C9M2 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ccdc15Q8C9M2 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ccdc15Q8C9M2 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.5 ms