Protein–RNA interactions for Protein: Q8C6E1

Apol7c, Apolipoprotein L 7c, mousemouse

Predictions only

Length 369 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apol7cQ8C6E1 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Apol7cQ8C6E1 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Apol7cQ8C6E1 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Apol7cQ8C6E1 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Apol7cQ8C6E1 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Apol7cQ8C6E1 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Apol7cQ8C6E1 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Apol7cQ8C6E1 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Apol7cQ8C6E1 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Apol7cQ8C6E1 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Apol7cQ8C6E1 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Apol7cQ8C6E1 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Apol7cQ8C6E1 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Apol7cQ8C6E1 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Apol7cQ8C6E1 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Apol7cQ8C6E1 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Apol7cQ8C6E1 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Apol7cQ8C6E1 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Apol7cQ8C6E1 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Apol7cQ8C6E1 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Apol7cQ8C6E1 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Apol7cQ8C6E1 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Apol7cQ8C6E1 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Apol7cQ8C6E1 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Apol7cQ8C6E1 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Apol7cQ8C6E1 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Apol7cQ8C6E1 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Apol7cQ8C6E1 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Apol7cQ8C6E1 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Apol7cQ8C6E1 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Apol7cQ8C6E1 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Apol7cQ8C6E1 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Apol7cQ8C6E1 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Apol7cQ8C6E1 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Apol7cQ8C6E1 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Apol7cQ8C6E1 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Apol7cQ8C6E1 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Apol7cQ8C6E1 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Apol7cQ8C6E1 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Apol7cQ8C6E1 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Apol7cQ8C6E1 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Apol7cQ8C6E1 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Apol7cQ8C6E1 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Apol7cQ8C6E1 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Apol7cQ8C6E1 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Apol7cQ8C6E1 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Apol7cQ8C6E1 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Apol7cQ8C6E1 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Apol7cQ8C6E1 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Apol7cQ8C6E1 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Apol7cQ8C6E1 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Apol7cQ8C6E1 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Apol7cQ8C6E1 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Apol7cQ8C6E1 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Apol7cQ8C6E1 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Apol7cQ8C6E1 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Apol7cQ8C6E1 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Apol7cQ8C6E1 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Apol7cQ8C6E1 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Apol7cQ8C6E1 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Apol7cQ8C6E1 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Apol7cQ8C6E1 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Apol7cQ8C6E1 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Apol7cQ8C6E1 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Apol7cQ8C6E1 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Apol7cQ8C6E1 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Apol7cQ8C6E1 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Apol7cQ8C6E1 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Apol7cQ8C6E1 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Apol7cQ8C6E1 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Apol7cQ8C6E1 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Apol7cQ8C6E1 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Apol7cQ8C6E1 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Apol7cQ8C6E1 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Apol7cQ8C6E1 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Apol7cQ8C6E1 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Apol7cQ8C6E1 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Apol7cQ8C6E1 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Apol7cQ8C6E1 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Apol7cQ8C6E1 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Apol7cQ8C6E1 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Apol7cQ8C6E1 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Apol7cQ8C6E1 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Apol7cQ8C6E1 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Apol7cQ8C6E1 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Apol7cQ8C6E1 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Apol7cQ8C6E1 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Apol7cQ8C6E1 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Apol7cQ8C6E1 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Apol7cQ8C6E1 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Apol7cQ8C6E1 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Apol7cQ8C6E1 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Apol7cQ8C6E1 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Apol7cQ8C6E1 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Apol7cQ8C6E1 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Apol7cQ8C6E1 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Apol7cQ8C6E1 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Apol7cQ8C6E1 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Apol7cQ8C6E1 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Apol7cQ8C6E1 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms