Protein–RNA interactions for Protein: Q8C6A8

Bhlhe22, Class E basic helix-loop-helix protein 22, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlhe22Q8C6A8 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Bhlhe22Q8C6A8 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Bhlhe22Q8C6A8 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Bhlhe22Q8C6A8 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Bhlhe22Q8C6A8 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Bhlhe22Q8C6A8 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Bhlhe22Q8C6A8 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Bhlhe22Q8C6A8 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Bhlhe22Q8C6A8 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Bhlhe22Q8C6A8 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Bhlhe22Q8C6A8 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Bhlhe22Q8C6A8 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Bhlhe22Q8C6A8 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Bhlhe22Q8C6A8 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Bhlhe22Q8C6A8 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Bhlhe22Q8C6A8 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Bhlhe22Q8C6A8 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Bhlhe22Q8C6A8 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Bhlhe22Q8C6A8 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Bhlhe22Q8C6A8 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Bhlhe22Q8C6A8 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Bhlhe22Q8C6A8 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Bhlhe22Q8C6A8 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Bhlhe22Q8C6A8 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Bhlhe22Q8C6A8 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Bhlhe22Q8C6A8 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Bhlhe22Q8C6A8 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Bhlhe22Q8C6A8 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Bhlhe22Q8C6A8 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Bhlhe22Q8C6A8 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Bhlhe22Q8C6A8 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Bhlhe22Q8C6A8 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Bhlhe22Q8C6A8 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Bhlhe22Q8C6A8 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Bhlhe22Q8C6A8 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Bhlhe22Q8C6A8 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Bhlhe22Q8C6A8 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Bhlhe22Q8C6A8 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Bhlhe22Q8C6A8 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Bhlhe22Q8C6A8 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Bhlhe22Q8C6A8 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Bhlhe22Q8C6A8 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Bhlhe22Q8C6A8 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Bhlhe22Q8C6A8 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Bhlhe22Q8C6A8 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Bhlhe22Q8C6A8 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Bhlhe22Q8C6A8 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Bhlhe22Q8C6A8 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Bhlhe22Q8C6A8 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Bhlhe22Q8C6A8 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Bhlhe22Q8C6A8 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Bhlhe22Q8C6A8 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.7■■□□□ 1.07
Bhlhe22Q8C6A8 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Bhlhe22Q8C6A8 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Bhlhe22Q8C6A8 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Bhlhe22Q8C6A8 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Bhlhe22Q8C6A8 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Bhlhe22Q8C6A8 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Bhlhe22Q8C6A8 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Bhlhe22Q8C6A8 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Bhlhe22Q8C6A8 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Bhlhe22Q8C6A8 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Bhlhe22Q8C6A8 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Bhlhe22Q8C6A8 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Bhlhe22Q8C6A8 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Bhlhe22Q8C6A8 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Bhlhe22Q8C6A8 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Bhlhe22Q8C6A8 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Bhlhe22Q8C6A8 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Bhlhe22Q8C6A8 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Bhlhe22Q8C6A8 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Bhlhe22Q8C6A8 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Bhlhe22Q8C6A8 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Bhlhe22Q8C6A8 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Bhlhe22Q8C6A8 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Bhlhe22Q8C6A8 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Bhlhe22Q8C6A8 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Bhlhe22Q8C6A8 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Bhlhe22Q8C6A8 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Bhlhe22Q8C6A8 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Bhlhe22Q8C6A8 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Bhlhe22Q8C6A8 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Bhlhe22Q8C6A8 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Bhlhe22Q8C6A8 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Bhlhe22Q8C6A8 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Bhlhe22Q8C6A8 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Bhlhe22Q8C6A8 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Bhlhe22Q8C6A8 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Bhlhe22Q8C6A8 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Bhlhe22Q8C6A8 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Bhlhe22Q8C6A8 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Bhlhe22Q8C6A8 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Bhlhe22Q8C6A8 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Bhlhe22Q8C6A8 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Bhlhe22Q8C6A8 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Bhlhe22Q8C6A8 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Bhlhe22Q8C6A8 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Bhlhe22Q8C6A8 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Bhlhe22Q8C6A8 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Bhlhe22Q8C6A8 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.6 ms