Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXA6

Cldn17, Claudin-17, mousemouse

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Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn17Q8BXA6 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cldn17Q8BXA6 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cldn17Q8BXA6 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cldn17Q8BXA6 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cldn17Q8BXA6 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cldn17Q8BXA6 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cldn17Q8BXA6 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cldn17Q8BXA6 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cldn17Q8BXA6 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cldn17Q8BXA6 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cldn17Q8BXA6 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cldn17Q8BXA6 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cldn17Q8BXA6 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cldn17Q8BXA6 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cldn17Q8BXA6 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Cldn17Q8BXA6 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cldn17Q8BXA6 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cldn17Q8BXA6 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cldn17Q8BXA6 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cldn17Q8BXA6 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cldn17Q8BXA6 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cldn17Q8BXA6 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Cldn17Q8BXA6 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cldn17Q8BXA6 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cldn17Q8BXA6 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cldn17Q8BXA6 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cldn17Q8BXA6 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cldn17Q8BXA6 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cldn17Q8BXA6 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cldn17Q8BXA6 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cldn17Q8BXA6 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cldn17Q8BXA6 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cldn17Q8BXA6 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cldn17Q8BXA6 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cldn17Q8BXA6 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cldn17Q8BXA6 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cldn17Q8BXA6 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cldn17Q8BXA6 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cldn17Q8BXA6 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cldn17Q8BXA6 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cldn17Q8BXA6 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cldn17Q8BXA6 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cldn17Q8BXA6 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cldn17Q8BXA6 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cldn17Q8BXA6 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Cldn17Q8BXA6 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Cldn17Q8BXA6 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cldn17Q8BXA6 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cldn17Q8BXA6 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cldn17Q8BXA6 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cldn17Q8BXA6 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cldn17Q8BXA6 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cldn17Q8BXA6 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cldn17Q8BXA6 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cldn17Q8BXA6 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cldn17Q8BXA6 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cldn17Q8BXA6 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cldn17Q8BXA6 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cldn17Q8BXA6 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cldn17Q8BXA6 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cldn17Q8BXA6 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Cldn17Q8BXA6 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cldn17Q8BXA6 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cldn17Q8BXA6 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cldn17Q8BXA6 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cldn17Q8BXA6 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cldn17Q8BXA6 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cldn17Q8BXA6 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cldn17Q8BXA6 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cldn17Q8BXA6 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Cldn17Q8BXA6 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cldn17Q8BXA6 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cldn17Q8BXA6 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cldn17Q8BXA6 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cldn17Q8BXA6 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cldn17Q8BXA6 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Cldn17Q8BXA6 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cldn17Q8BXA6 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cldn17Q8BXA6 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cldn17Q8BXA6 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
Cldn17Q8BXA6 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cldn17Q8BXA6 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cldn17Q8BXA6 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cldn17Q8BXA6 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cldn17Q8BXA6 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Cldn17Q8BXA6 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Cldn17Q8BXA6 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Cldn17Q8BXA6 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Cldn17Q8BXA6 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Cldn17Q8BXA6 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Cldn17Q8BXA6 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Cldn17Q8BXA6 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Cldn17Q8BXA6 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
Cldn17Q8BXA6 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Cldn17Q8BXA6 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Cldn17Q8BXA6 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Cldn17Q8BXA6 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Cldn17Q8BXA6 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Cldn17Q8BXA6 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Cldn17Q8BXA6 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 185.9 ms