Protein–RNA interactions for Protein: Q8BU27

Ppm1m, Protein phosphatase 1M, mousemouse

Predictions only

Length 406 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppm1mQ8BU27 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
Ppm1mQ8BU27 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Ppm1mQ8BU27 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Ppm1mQ8BU27 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Ppm1mQ8BU27 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Ppm1mQ8BU27 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Ppm1mQ8BU27 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Ppm1mQ8BU27 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Ppm1mQ8BU27 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Ppm1mQ8BU27 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Ppm1mQ8BU27 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Ppm1mQ8BU27 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Ppm1mQ8BU27 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Ppm1mQ8BU27 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
Ppm1mQ8BU27 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Ppm1mQ8BU27 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Ppm1mQ8BU27 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Ppm1mQ8BU27 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Ppm1mQ8BU27 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Ppm1mQ8BU27 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Ppm1mQ8BU27 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Ppm1mQ8BU27 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Ppm1mQ8BU27 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Ppm1mQ8BU27 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Ppm1mQ8BU27 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Ppm1mQ8BU27 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Ppm1mQ8BU27 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
Ppm1mQ8BU27 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Ppm1mQ8BU27 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Ppm1mQ8BU27 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Ppm1mQ8BU27 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Ppm1mQ8BU27 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Ppm1mQ8BU27 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Ppm1mQ8BU27 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Ppm1mQ8BU27 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Ppm1mQ8BU27 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Ppm1mQ8BU27 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
Ppm1mQ8BU27 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Ppm1mQ8BU27 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Ppm1mQ8BU27 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Ppm1mQ8BU27 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Ppm1mQ8BU27 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Ppm1mQ8BU27 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Ppm1mQ8BU27 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Ppm1mQ8BU27 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Ppm1mQ8BU27 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Ppm1mQ8BU27 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
Ppm1mQ8BU27 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Ppm1mQ8BU27 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Ppm1mQ8BU27 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Ppm1mQ8BU27 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Ppm1mQ8BU27 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Ppm1mQ8BU27 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Ppm1mQ8BU27 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Ppm1mQ8BU27 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Ppm1mQ8BU27 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Ppm1mQ8BU27 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Ppm1mQ8BU27 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Ppm1mQ8BU27 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Ppm1mQ8BU27 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Ppm1mQ8BU27 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Ppm1mQ8BU27 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Ppm1mQ8BU27 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
Ppm1mQ8BU27 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Ppm1mQ8BU27 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Ppm1mQ8BU27 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Ppm1mQ8BU27 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Ppm1mQ8BU27 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Ppm1mQ8BU27 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Ppm1mQ8BU27 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Ppm1mQ8BU27 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
Ppm1mQ8BU27 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Ppm1mQ8BU27 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Ppm1mQ8BU27 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Ppm1mQ8BU27 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Ppm1mQ8BU27 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Ppm1mQ8BU27 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Ppm1mQ8BU27 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Ppm1mQ8BU27 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Ppm1mQ8BU27 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Ppm1mQ8BU27 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Ppm1mQ8BU27 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Ppm1mQ8BU27 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Ppm1mQ8BU27 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Ppm1mQ8BU27 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Ppm1mQ8BU27 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Ppm1mQ8BU27 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Ppm1mQ8BU27 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Ppm1mQ8BU27 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Ppm1mQ8BU27 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Ppm1mQ8BU27 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Ppm1mQ8BU27 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Ppm1mQ8BU27 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Ppm1mQ8BU27 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC28■■■□□ 2.07
Ppm1mQ8BU27 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Ppm1mQ8BU27 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Ppm1mQ8BU27 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Ppm1mQ8BU27 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
Ppm1mQ8BU27 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Ppm1mQ8BU27 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 163.6 ms