Protein–RNA interactions for Protein: Q8BG07

Pld4, Phospholipase D4, mousemouse

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pld4Q8BG07 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pld4Q8BG07 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pld4Q8BG07 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pld4Q8BG07 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pld4Q8BG07 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pld4Q8BG07 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Pld4Q8BG07 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Pld4Q8BG07 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Pld4Q8BG07 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Pld4Q8BG07 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Pld4Q8BG07 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Pld4Q8BG07 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pld4Q8BG07 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pld4Q8BG07 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pld4Q8BG07 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pld4Q8BG07 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Pld4Q8BG07 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Pld4Q8BG07 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Pld4Q8BG07 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Pld4Q8BG07 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Pld4Q8BG07 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Pld4Q8BG07 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Pld4Q8BG07 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Pld4Q8BG07 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Pld4Q8BG07 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Pld4Q8BG07 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Pld4Q8BG07 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Pld4Q8BG07 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Pld4Q8BG07 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Pld4Q8BG07 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Pld4Q8BG07 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Pld4Q8BG07 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pld4Q8BG07 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pld4Q8BG07 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pld4Q8BG07 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pld4Q8BG07 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pld4Q8BG07 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pld4Q8BG07 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pld4Q8BG07 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pld4Q8BG07 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Pld4Q8BG07 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Pld4Q8BG07 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Pld4Q8BG07 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Pld4Q8BG07 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Pld4Q8BG07 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Pld4Q8BG07 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Pld4Q8BG07 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Pld4Q8BG07 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Pld4Q8BG07 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Pld4Q8BG07 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Pld4Q8BG07 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Pld4Q8BG07 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Pld4Q8BG07 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Pld4Q8BG07 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Pld4Q8BG07 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Pld4Q8BG07 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Pld4Q8BG07 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Pld4Q8BG07 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Pld4Q8BG07 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Pld4Q8BG07 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Pld4Q8BG07 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Pld4Q8BG07 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Pld4Q8BG07 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Pld4Q8BG07 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Pld4Q8BG07 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Pld4Q8BG07 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Pld4Q8BG07 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Pld4Q8BG07 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Pld4Q8BG07 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Pld4Q8BG07 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Pld4Q8BG07 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Pld4Q8BG07 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Pld4Q8BG07 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Pld4Q8BG07 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Pld4Q8BG07 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Pld4Q8BG07 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Pld4Q8BG07 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Pld4Q8BG07 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Pld4Q8BG07 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Pld4Q8BG07 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Pld4Q8BG07 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Pld4Q8BG07 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Pld4Q8BG07 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Pld4Q8BG07 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Pld4Q8BG07 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Pld4Q8BG07 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Pld4Q8BG07 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Pld4Q8BG07 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Pld4Q8BG07 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Pld4Q8BG07 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Pld4Q8BG07 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Pld4Q8BG07 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Pld4Q8BG07 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Pld4Q8BG07 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Pld4Q8BG07 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Pld4Q8BG07 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Pld4Q8BG07 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Pld4Q8BG07 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Pld4Q8BG07 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Pld4Q8BG07 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms