Protein–RNA interactions for Protein: Q8BFW4

Trim65, Tripartite motif-containing protein 65, mousemouse

Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim65Q8BFW4 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Trim65Q8BFW4 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
Trim65Q8BFW4 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Trim65Q8BFW4 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Trim65Q8BFW4 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Trim65Q8BFW4 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Trim65Q8BFW4 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Trim65Q8BFW4 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Trim65Q8BFW4 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Trim65Q8BFW4 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Trim65Q8BFW4 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Trim65Q8BFW4 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Trim65Q8BFW4 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Trim65Q8BFW4 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Trim65Q8BFW4 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Trim65Q8BFW4 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Trim65Q8BFW4 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Trim65Q8BFW4 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Trim65Q8BFW4 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Trim65Q8BFW4 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Trim65Q8BFW4 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Trim65Q8BFW4 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Trim65Q8BFW4 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Trim65Q8BFW4 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Trim65Q8BFW4 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Trim65Q8BFW4 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Trim65Q8BFW4 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Trim65Q8BFW4 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Trim65Q8BFW4 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Trim65Q8BFW4 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Trim65Q8BFW4 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Trim65Q8BFW4 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Trim65Q8BFW4 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Trim65Q8BFW4 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Trim65Q8BFW4 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Trim65Q8BFW4 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Trim65Q8BFW4 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Trim65Q8BFW4 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Trim65Q8BFW4 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Trim65Q8BFW4 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Trim65Q8BFW4 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Trim65Q8BFW4 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Trim65Q8BFW4 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Trim65Q8BFW4 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Trim65Q8BFW4 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Trim65Q8BFW4 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Trim65Q8BFW4 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Trim65Q8BFW4 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Trim65Q8BFW4 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Trim65Q8BFW4 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Trim65Q8BFW4 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Trim65Q8BFW4 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Trim65Q8BFW4 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Trim65Q8BFW4 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Trim65Q8BFW4 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Trim65Q8BFW4 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Trim65Q8BFW4 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Trim65Q8BFW4 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Trim65Q8BFW4 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Trim65Q8BFW4 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Trim65Q8BFW4 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Trim65Q8BFW4 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Trim65Q8BFW4 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Trim65Q8BFW4 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Trim65Q8BFW4 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Trim65Q8BFW4 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Trim65Q8BFW4 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Trim65Q8BFW4 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Trim65Q8BFW4 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Trim65Q8BFW4 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Trim65Q8BFW4 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Trim65Q8BFW4 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Trim65Q8BFW4 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Trim65Q8BFW4 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Trim65Q8BFW4 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Trim65Q8BFW4 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Trim65Q8BFW4 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Trim65Q8BFW4 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Trim65Q8BFW4 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Trim65Q8BFW4 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Trim65Q8BFW4 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Trim65Q8BFW4 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Trim65Q8BFW4 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Trim65Q8BFW4 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Trim65Q8BFW4 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Trim65Q8BFW4 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Trim65Q8BFW4 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Trim65Q8BFW4 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Trim65Q8BFW4 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Trim65Q8BFW4 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Trim65Q8BFW4 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Trim65Q8BFW4 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Trim65Q8BFW4 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Trim65Q8BFW4 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Trim65Q8BFW4 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Trim65Q8BFW4 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Trim65Q8BFW4 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Trim65Q8BFW4 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Trim65Q8BFW4 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Trim65Q8BFW4 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms