Protein–RNA interactions for Protein: Q8BFU0

Rspo2, R-spondin-2, mousemouse

Predictions only

Length 243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rspo2Q8BFU0 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rspo2Q8BFU0 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rspo2Q8BFU0 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Rspo2Q8BFU0 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Rspo2Q8BFU0 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rspo2Q8BFU0 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rspo2Q8BFU0 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rspo2Q8BFU0 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rspo2Q8BFU0 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rspo2Q8BFU0 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rspo2Q8BFU0 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rspo2Q8BFU0 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rspo2Q8BFU0 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rspo2Q8BFU0 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rspo2Q8BFU0 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rspo2Q8BFU0 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rspo2Q8BFU0 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rspo2Q8BFU0 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rspo2Q8BFU0 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rspo2Q8BFU0 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rspo2Q8BFU0 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rspo2Q8BFU0 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rspo2Q8BFU0 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rspo2Q8BFU0 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rspo2Q8BFU0 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rspo2Q8BFU0 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rspo2Q8BFU0 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rspo2Q8BFU0 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rspo2Q8BFU0 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rspo2Q8BFU0 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rspo2Q8BFU0 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rspo2Q8BFU0 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rspo2Q8BFU0 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rspo2Q8BFU0 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rspo2Q8BFU0 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rspo2Q8BFU0 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rspo2Q8BFU0 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rspo2Q8BFU0 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rspo2Q8BFU0 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rspo2Q8BFU0 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rspo2Q8BFU0 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rspo2Q8BFU0 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Rspo2Q8BFU0 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rspo2Q8BFU0 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rspo2Q8BFU0 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rspo2Q8BFU0 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Rspo2Q8BFU0 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Rspo2Q8BFU0 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Rspo2Q8BFU0 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Rspo2Q8BFU0 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rspo2Q8BFU0 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rspo2Q8BFU0 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rspo2Q8BFU0 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rspo2Q8BFU0 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rspo2Q8BFU0 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rspo2Q8BFU0 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rspo2Q8BFU0 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rspo2Q8BFU0 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rspo2Q8BFU0 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rspo2Q8BFU0 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rspo2Q8BFU0 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rspo2Q8BFU0 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rspo2Q8BFU0 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rspo2Q8BFU0 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rspo2Q8BFU0 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rspo2Q8BFU0 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rspo2Q8BFU0 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rspo2Q8BFU0 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rspo2Q8BFU0 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Rspo2Q8BFU0 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rspo2Q8BFU0 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rspo2Q8BFU0 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rspo2Q8BFU0 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rspo2Q8BFU0 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rspo2Q8BFU0 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rspo2Q8BFU0 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rspo2Q8BFU0 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rspo2Q8BFU0 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rspo2Q8BFU0 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rspo2Q8BFU0 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rspo2Q8BFU0 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rspo2Q8BFU0 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rspo2Q8BFU0 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rspo2Q8BFU0 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rspo2Q8BFU0 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rspo2Q8BFU0 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rspo2Q8BFU0 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rspo2Q8BFU0 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rspo2Q8BFU0 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rspo2Q8BFU0 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rspo2Q8BFU0 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rspo2Q8BFU0 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rspo2Q8BFU0 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rspo2Q8BFU0 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rspo2Q8BFU0 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rspo2Q8BFU0 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Rspo2Q8BFU0 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rspo2Q8BFU0 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rspo2Q8BFU0 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rspo2Q8BFU0 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 160.2 ms