Protein–RNA interactions for Protein: Q85ZW5

H2-M10.6, Histocompatibility 2, M region locus 10.6, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M10.6Q85ZW5 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
H2-M10.6Q85ZW5 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
H2-M10.6Q85ZW5 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
H2-M10.6Q85ZW5 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
H2-M10.6Q85ZW5 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
H2-M10.6Q85ZW5 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
H2-M10.6Q85ZW5 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
H2-M10.6Q85ZW5 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
H2-M10.6Q85ZW5 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
H2-M10.6Q85ZW5 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
H2-M10.6Q85ZW5 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
H2-M10.6Q85ZW5 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
H2-M10.6Q85ZW5 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
H2-M10.6Q85ZW5 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
H2-M10.6Q85ZW5 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
H2-M10.6Q85ZW5 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
H2-M10.6Q85ZW5 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
H2-M10.6Q85ZW5 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
H2-M10.6Q85ZW5 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
H2-M10.6Q85ZW5 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
H2-M10.6Q85ZW5 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
H2-M10.6Q85ZW5 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
H2-M10.6Q85ZW5 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
H2-M10.6Q85ZW5 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
H2-M10.6Q85ZW5 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
H2-M10.6Q85ZW5 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
H2-M10.6Q85ZW5 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
H2-M10.6Q85ZW5 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
H2-M10.6Q85ZW5 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
H2-M10.6Q85ZW5 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
H2-M10.6Q85ZW5 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
H2-M10.6Q85ZW5 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
H2-M10.6Q85ZW5 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
H2-M10.6Q85ZW5 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
H2-M10.6Q85ZW5 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
H2-M10.6Q85ZW5 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
H2-M10.6Q85ZW5 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
H2-M10.6Q85ZW5 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
H2-M10.6Q85ZW5 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
H2-M10.6Q85ZW5 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
H2-M10.6Q85ZW5 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
H2-M10.6Q85ZW5 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
H2-M10.6Q85ZW5 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
H2-M10.6Q85ZW5 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
H2-M10.6Q85ZW5 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
H2-M10.6Q85ZW5 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
H2-M10.6Q85ZW5 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
H2-M10.6Q85ZW5 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
H2-M10.6Q85ZW5 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
H2-M10.6Q85ZW5 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
H2-M10.6Q85ZW5 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
H2-M10.6Q85ZW5 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
H2-M10.6Q85ZW5 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
H2-M10.6Q85ZW5 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
H2-M10.6Q85ZW5 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
H2-M10.6Q85ZW5 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
H2-M10.6Q85ZW5 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
H2-M10.6Q85ZW5 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
H2-M10.6Q85ZW5 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
H2-M10.6Q85ZW5 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
H2-M10.6Q85ZW5 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
H2-M10.6Q85ZW5 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
H2-M10.6Q85ZW5 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
H2-M10.6Q85ZW5 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
H2-M10.6Q85ZW5 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
H2-M10.6Q85ZW5 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
H2-M10.6Q85ZW5 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
H2-M10.6Q85ZW5 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
H2-M10.6Q85ZW5 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
H2-M10.6Q85ZW5 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
H2-M10.6Q85ZW5 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
H2-M10.6Q85ZW5 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
H2-M10.6Q85ZW5 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
H2-M10.6Q85ZW5 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
H2-M10.6Q85ZW5 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
H2-M10.6Q85ZW5 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
H2-M10.6Q85ZW5 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
H2-M10.6Q85ZW5 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
H2-M10.6Q85ZW5 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
H2-M10.6Q85ZW5 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
H2-M10.6Q85ZW5 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
H2-M10.6Q85ZW5 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
H2-M10.6Q85ZW5 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
H2-M10.6Q85ZW5 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
H2-M10.6Q85ZW5 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
H2-M10.6Q85ZW5 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
H2-M10.6Q85ZW5 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
H2-M10.6Q85ZW5 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
H2-M10.6Q85ZW5 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
H2-M10.6Q85ZW5 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
H2-M10.6Q85ZW5 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
H2-M10.6Q85ZW5 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
H2-M10.6Q85ZW5 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
H2-M10.6Q85ZW5 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
H2-M10.6Q85ZW5 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
H2-M10.6Q85ZW5 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
H2-M10.6Q85ZW5 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
H2-M10.6Q85ZW5 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
H2-M10.6Q85ZW5 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
H2-M10.6Q85ZW5 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms