Protein–RNA interactions for Protein: Q80WJ1

Ggn, Gametogenetin, mousemouse

Predictions only

Length 673 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GgnQ80WJ1 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GgnQ80WJ1 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GgnQ80WJ1 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GgnQ80WJ1 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GgnQ80WJ1 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GgnQ80WJ1 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GgnQ80WJ1 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GgnQ80WJ1 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GgnQ80WJ1 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GgnQ80WJ1 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GgnQ80WJ1 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GgnQ80WJ1 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GgnQ80WJ1 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
GgnQ80WJ1 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.04
GgnQ80WJ1 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GgnQ80WJ1 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GgnQ80WJ1 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GgnQ80WJ1 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
GgnQ80WJ1 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GgnQ80WJ1 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GgnQ80WJ1 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GgnQ80WJ1 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GgnQ80WJ1 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GgnQ80WJ1 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GgnQ80WJ1 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GgnQ80WJ1 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GgnQ80WJ1 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GgnQ80WJ1 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GgnQ80WJ1 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GgnQ80WJ1 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GgnQ80WJ1 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GgnQ80WJ1 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GgnQ80WJ1 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GgnQ80WJ1 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
GgnQ80WJ1 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GgnQ80WJ1 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GgnQ80WJ1 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GgnQ80WJ1 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GgnQ80WJ1 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GgnQ80WJ1 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
GgnQ80WJ1 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
GgnQ80WJ1 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GgnQ80WJ1 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GgnQ80WJ1 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GgnQ80WJ1 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GgnQ80WJ1 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GgnQ80WJ1 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GgnQ80WJ1 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GgnQ80WJ1 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GgnQ80WJ1 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GgnQ80WJ1 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
GgnQ80WJ1 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GgnQ80WJ1 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GgnQ80WJ1 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GgnQ80WJ1 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GgnQ80WJ1 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GgnQ80WJ1 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GgnQ80WJ1 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GgnQ80WJ1 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GgnQ80WJ1 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GgnQ80WJ1 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GgnQ80WJ1 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GgnQ80WJ1 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GgnQ80WJ1 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GgnQ80WJ1 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GgnQ80WJ1 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GgnQ80WJ1 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GgnQ80WJ1 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GgnQ80WJ1 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
GgnQ80WJ1 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GgnQ80WJ1 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GgnQ80WJ1 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GgnQ80WJ1 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GgnQ80WJ1 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GgnQ80WJ1 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GgnQ80WJ1 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GgnQ80WJ1 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GgnQ80WJ1 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GgnQ80WJ1 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GgnQ80WJ1 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GgnQ80WJ1 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GgnQ80WJ1 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GgnQ80WJ1 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GgnQ80WJ1 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GgnQ80WJ1 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GgnQ80WJ1 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GgnQ80WJ1 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GgnQ80WJ1 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GgnQ80WJ1 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GgnQ80WJ1 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GgnQ80WJ1 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GgnQ80WJ1 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GgnQ80WJ1 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
GgnQ80WJ1 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GgnQ80WJ1 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
GgnQ80WJ1 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GgnQ80WJ1 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GgnQ80WJ1 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GgnQ80WJ1 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GgnQ80WJ1 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 168.4 ms