Protein–RNA interactions for Protein: Q80W37

Snupn, Snurportin-1, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnupnQ80W37 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SnupnQ80W37 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
SnupnQ80W37 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SnupnQ80W37 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SnupnQ80W37 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SnupnQ80W37 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SnupnQ80W37 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SnupnQ80W37 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SnupnQ80W37 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
SnupnQ80W37 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SnupnQ80W37 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SnupnQ80W37 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SnupnQ80W37 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SnupnQ80W37 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SnupnQ80W37 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SnupnQ80W37 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SnupnQ80W37 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SnupnQ80W37 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SnupnQ80W37 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SnupnQ80W37 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SnupnQ80W37 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SnupnQ80W37 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SnupnQ80W37 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SnupnQ80W37 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SnupnQ80W37 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SnupnQ80W37 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SnupnQ80W37 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SnupnQ80W37 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SnupnQ80W37 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SnupnQ80W37 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SnupnQ80W37 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SnupnQ80W37 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SnupnQ80W37 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SnupnQ80W37 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SnupnQ80W37 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SnupnQ80W37 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SnupnQ80W37 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SnupnQ80W37 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SnupnQ80W37 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
SnupnQ80W37 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SnupnQ80W37 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SnupnQ80W37 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SnupnQ80W37 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SnupnQ80W37 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SnupnQ80W37 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SnupnQ80W37 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SnupnQ80W37 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SnupnQ80W37 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SnupnQ80W37 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SnupnQ80W37 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SnupnQ80W37 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SnupnQ80W37 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SnupnQ80W37 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
SnupnQ80W37 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SnupnQ80W37 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SnupnQ80W37 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SnupnQ80W37 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SnupnQ80W37 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SnupnQ80W37 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SnupnQ80W37 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SnupnQ80W37 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SnupnQ80W37 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SnupnQ80W37 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SnupnQ80W37 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SnupnQ80W37 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SnupnQ80W37 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SnupnQ80W37 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SnupnQ80W37 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SnupnQ80W37 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SnupnQ80W37 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SnupnQ80W37 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SnupnQ80W37 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SnupnQ80W37 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SnupnQ80W37 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SnupnQ80W37 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SnupnQ80W37 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SnupnQ80W37 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SnupnQ80W37 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SnupnQ80W37 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SnupnQ80W37 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SnupnQ80W37 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SnupnQ80W37 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SnupnQ80W37 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SnupnQ80W37 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
SnupnQ80W37 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SnupnQ80W37 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
SnupnQ80W37 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SnupnQ80W37 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SnupnQ80W37 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SnupnQ80W37 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SnupnQ80W37 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SnupnQ80W37 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SnupnQ80W37 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SnupnQ80W37 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SnupnQ80W37 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SnupnQ80W37 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SnupnQ80W37 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SnupnQ80W37 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SnupnQ80W37 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SnupnQ80W37 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms