Protein–RNA interactions for Protein: Q80VM3

Ttc29, Tetratricopeptide repeat protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 471 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc29Q80VM3 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ttc29Q80VM3 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ttc29Q80VM3 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ttc29Q80VM3 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ttc29Q80VM3 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ttc29Q80VM3 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ttc29Q80VM3 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ttc29Q80VM3 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ttc29Q80VM3 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Ttc29Q80VM3 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ttc29Q80VM3 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ttc29Q80VM3 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ttc29Q80VM3 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ttc29Q80VM3 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Ttc29Q80VM3 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ttc29Q80VM3 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ttc29Q80VM3 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ttc29Q80VM3 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ttc29Q80VM3 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ttc29Q80VM3 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ttc29Q80VM3 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ttc29Q80VM3 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ttc29Q80VM3 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ttc29Q80VM3 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Ttc29Q80VM3 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ttc29Q80VM3 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ttc29Q80VM3 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ttc29Q80VM3 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Ttc29Q80VM3 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ttc29Q80VM3 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ttc29Q80VM3 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ttc29Q80VM3 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ttc29Q80VM3 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ttc29Q80VM3 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ttc29Q80VM3 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Ttc29Q80VM3 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ttc29Q80VM3 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ttc29Q80VM3 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ttc29Q80VM3 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ttc29Q80VM3 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ttc29Q80VM3 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ttc29Q80VM3 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ttc29Q80VM3 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ttc29Q80VM3 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ttc29Q80VM3 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ttc29Q80VM3 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ttc29Q80VM3 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ttc29Q80VM3 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ttc29Q80VM3 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ttc29Q80VM3 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ttc29Q80VM3 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ttc29Q80VM3 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ttc29Q80VM3 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ttc29Q80VM3 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ttc29Q80VM3 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Ttc29Q80VM3 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ttc29Q80VM3 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ttc29Q80VM3 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ttc29Q80VM3 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ttc29Q80VM3 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ttc29Q80VM3 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ttc29Q80VM3 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ttc29Q80VM3 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ttc29Q80VM3 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ttc29Q80VM3 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ttc29Q80VM3 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ttc29Q80VM3 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ttc29Q80VM3 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ttc29Q80VM3 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ttc29Q80VM3 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ttc29Q80VM3 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ttc29Q80VM3 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ttc29Q80VM3 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ttc29Q80VM3 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ttc29Q80VM3 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ttc29Q80VM3 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ttc29Q80VM3 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Ttc29Q80VM3 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Ttc29Q80VM3 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ttc29Q80VM3 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ttc29Q80VM3 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ttc29Q80VM3 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ttc29Q80VM3 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ttc29Q80VM3 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ttc29Q80VM3 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ttc29Q80VM3 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ttc29Q80VM3 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Ttc29Q80VM3 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ttc29Q80VM3 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ttc29Q80VM3 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ttc29Q80VM3 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ttc29Q80VM3 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ttc29Q80VM3 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ttc29Q80VM3 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ttc29Q80VM3 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ttc29Q80VM3 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ttc29Q80VM3 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ttc29Q80VM3 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ttc29Q80VM3 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ttc29Q80VM3 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms