Protein–RNA interactions for Protein: Q80U04

Pja2, E3 ubiquitin-protein ligase Praja-2, mousemouse

Predictions only

Length 707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pja2Q80U04 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pja2Q80U04 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pja2Q80U04 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pja2Q80U04 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pja2Q80U04 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pja2Q80U04 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pja2Q80U04 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pja2Q80U04 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pja2Q80U04 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pja2Q80U04 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Pja2Q80U04 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pja2Q80U04 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pja2Q80U04 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pja2Q80U04 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pja2Q80U04 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pja2Q80U04 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pja2Q80U04 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pja2Q80U04 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pja2Q80U04 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pja2Q80U04 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pja2Q80U04 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pja2Q80U04 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pja2Q80U04 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pja2Q80U04 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pja2Q80U04 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pja2Q80U04 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pja2Q80U04 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pja2Q80U04 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pja2Q80U04 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pja2Q80U04 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pja2Q80U04 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pja2Q80U04 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pja2Q80U04 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pja2Q80U04 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pja2Q80U04 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pja2Q80U04 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pja2Q80U04 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pja2Q80U04 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pja2Q80U04 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pja2Q80U04 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pja2Q80U04 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pja2Q80U04 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pja2Q80U04 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pja2Q80U04 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pja2Q80U04 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pja2Q80U04 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pja2Q80U04 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pja2Q80U04 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Pja2Q80U04 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pja2Q80U04 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pja2Q80U04 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pja2Q80U04 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pja2Q80U04 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pja2Q80U04 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pja2Q80U04 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pja2Q80U04 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pja2Q80U04 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pja2Q80U04 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pja2Q80U04 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pja2Q80U04 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Pja2Q80U04 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Pja2Q80U04 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pja2Q80U04 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pja2Q80U04 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pja2Q80U04 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pja2Q80U04 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pja2Q80U04 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pja2Q80U04 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pja2Q80U04 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pja2Q80U04 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pja2Q80U04 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pja2Q80U04 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pja2Q80U04 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pja2Q80U04 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pja2Q80U04 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pja2Q80U04 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pja2Q80U04 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pja2Q80U04 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pja2Q80U04 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pja2Q80U04 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pja2Q80U04 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pja2Q80U04 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pja2Q80U04 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pja2Q80U04 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pja2Q80U04 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pja2Q80U04 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pja2Q80U04 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Pja2Q80U04 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Pja2Q80U04 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Pja2Q80U04 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Pja2Q80U04 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Pja2Q80U04 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Pja2Q80U04 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Pja2Q80U04 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pja2Q80U04 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pja2Q80U04 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pja2Q80U04 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pja2Q80U04 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pja2Q80U04 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pja2Q80U04 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.9 ms