Protein–RNA interactions for Protein: Q80TB8

Vat1l, Synaptic vesicle membrane protein VAT-1 homolog-like, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vat1lQ80TB8 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Vat1lQ80TB8 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Vat1lQ80TB8 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Vat1lQ80TB8 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Vat1lQ80TB8 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Vat1lQ80TB8 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Vat1lQ80TB8 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Vat1lQ80TB8 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Vat1lQ80TB8 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Vat1lQ80TB8 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Vat1lQ80TB8 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Vat1lQ80TB8 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Vat1lQ80TB8 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Vat1lQ80TB8 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Vat1lQ80TB8 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Vat1lQ80TB8 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Vat1lQ80TB8 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Vat1lQ80TB8 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Vat1lQ80TB8 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Vat1lQ80TB8 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Vat1lQ80TB8 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Vat1lQ80TB8 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Vat1lQ80TB8 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Vat1lQ80TB8 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Vat1lQ80TB8 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Vat1lQ80TB8 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Vat1lQ80TB8 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Vat1lQ80TB8 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Vat1lQ80TB8 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Vat1lQ80TB8 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Vat1lQ80TB8 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Vat1lQ80TB8 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Vat1lQ80TB8 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Vat1lQ80TB8 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Vat1lQ80TB8 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Vat1lQ80TB8 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Vat1lQ80TB8 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Vat1lQ80TB8 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Vat1lQ80TB8 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Vat1lQ80TB8 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Vat1lQ80TB8 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Vat1lQ80TB8 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Vat1lQ80TB8 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Vat1lQ80TB8 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Vat1lQ80TB8 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Vat1lQ80TB8 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Vat1lQ80TB8 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Vat1lQ80TB8 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Vat1lQ80TB8 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Vat1lQ80TB8 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Vat1lQ80TB8 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Vat1lQ80TB8 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Vat1lQ80TB8 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Vat1lQ80TB8 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Vat1lQ80TB8 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Vat1lQ80TB8 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Vat1lQ80TB8 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Vat1lQ80TB8 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Vat1lQ80TB8 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Vat1lQ80TB8 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Vat1lQ80TB8 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Vat1lQ80TB8 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Vat1lQ80TB8 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Vat1lQ80TB8 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Vat1lQ80TB8 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Vat1lQ80TB8 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Vat1lQ80TB8 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Vat1lQ80TB8 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Vat1lQ80TB8 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Vat1lQ80TB8 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Vat1lQ80TB8 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Vat1lQ80TB8 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Vat1lQ80TB8 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Vat1lQ80TB8 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Vat1lQ80TB8 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Vat1lQ80TB8 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Vat1lQ80TB8 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Vat1lQ80TB8 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Vat1lQ80TB8 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Vat1lQ80TB8 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Vat1lQ80TB8 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Vat1lQ80TB8 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Vat1lQ80TB8 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Vat1lQ80TB8 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Vat1lQ80TB8 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Vat1lQ80TB8 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Vat1lQ80TB8 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Vat1lQ80TB8 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Vat1lQ80TB8 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Vat1lQ80TB8 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Vat1lQ80TB8 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Vat1lQ80TB8 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Vat1lQ80TB8 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Vat1lQ80TB8 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Vat1lQ80TB8 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Vat1lQ80TB8 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Vat1lQ80TB8 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Vat1lQ80TB8 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Vat1lQ80TB8 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Vat1lQ80TB8 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.5 ms